switch(value) {
    case 1:
        while(!Serial.available());
        char temp = Serial.read();
        // 処理が続く
        break;
    case 2:
        while(!Serial.available());
        char temp = Serial.read();
        // 処理が続く
        break;
    default:
        break;

このコード、Arduinoなら問題なくコンパイルは通ります。
ですが、実際に動かすと、case 1も2もdefaultもどれにも当てはまらないということになっています。
なぜなら、switch文の中で同じ変数が複数宣言されるからです。
正直に言って、コンパイルエラー出してほしかったです。
なので、解決策としては、

switch(value) {
    case 1:
        while(!Serial.available());
        {
            char temp = Serial.read();
            // 処理が続く
        }
        break;
    case 2:
        while(!Serial.available());
        {
            char temp = Serial.read();
            // 処理が続く
        }
        // 処理が続く
        break;
    default:
        break;

となります。

意外と気づきにくいバグ(だと個人的に思っています)