タイトルのままなのですが、WP2StaticにてクロールするURLを追加/削除するための
フィルターがあるので、そちらの紹介です。
公式ページには書いておらず、GitHubにあるドキュメントを読まないとわからないという…。
ちょっと調べるのも面倒だったので、こちらに書いておこうと思います。

wp2static_modify_initial_crawl_list

WP2StaticはクロールするURLが自動で生成されるのですが、クロールするURLを変更できるwp2static_modify_initial_crawl_listというフィルターフックが用意されています。

apply_filters(
    'wp2static_modify_initial_crawl_list',
    $url_queue
);

$url_queue にクロール対象になるURLが入ります。
最終的にこの変数をクロールさせたいURLのみにします。

サンプル

追加

追加したいURLがある時は$url_queueに追加して返します。
この場合は$additional_urlsで指定しているURLがクロール先として追加されます。
以下は公式にのっているものをちょちょっと書き直したものです。

function add_additional_urls( $url_queue ) 
{
    $additional_urls = [
        '/custom_link_1/',
        '/custom_link_2/',
    ];

    $url_queue = array_merge(
        $url_queue,
        $additional_urls
    );

    return $url_queue;

}
add_filter('wp2static_modify_initial_crawl_list', 'add_additional_urls');

削除

逆にクロールしてほしくないURLは$url_queueから削除します。
（いろいろやり方はあると思いますが、例を…。）

例：クロール対象のURLが以下で、entry_23をクロール対象外とする場合
/blog/entry_22/
/blog/entry_23/
/blog/entry_24/
/blog/entry_39/

function remove_extra_urls($url_queue) 
{
	$idx = array_search('/blog/entry_23/',$url_queue);
	if($idx !== false) 
	{
	    array_splice($url_queue,$idx,1);
	}

    return $url_queue;
}

add_filter('wp2static_modify_initial_crawl_list', 'remove_extra_urls');

※書き方はいろいろあると思います…。最終的にクロールしてほしくないURLをぬいたものがreturnできていればよいです。

クロール対象は以下のURLになります。
/blog/entry_22/
/blog/entry_24/
/blog/entry_39/

注意事項など

add_filterで関数をひっかけていくのですが、追加/削除の関数を別にしている場合は
関数の実行順序管理をしっかりとしてないとちょっと泣きます。

WP2Staticの自動検出だと日付アーカイブはクロールされないので自分で作成した関数で追加し、テーマフォルダの中にあるjsなどを拾いに行ってしまうので、削除したり。
自動だとちょっと上手くいかない…というときはどうぞ。