#はじめに
Linuxのディレクトリ構造はFHS(Filesystem Hierarchy Standard)という規格にしたがってつくられており、歴史があるものらしいので自分なりに調べてみました。
詳しく知りたいよという人はこちらを参照ください。
→Filesystem Hierarchy Standard

#基本編
現在のFHS（FHS 3.0）で規定された、ルートディレクトリ直下のディレクトリで必須とされているものは、「/bin」「/boot」「/dev」「/etc」「/lib」「/media」「/mnt」「/opt」「/run」「/sbin」「/srv」「/tmp」「/usr」「/var」の14個です（「/home」「/root」についてはオプションとして規定）。

ディレクトリ	役割
/	ルートディレクトリ。ここが階層の起点。
/bin	シングルユーザーモードでシステムの起動や修理を行う際に必要な実行形式ファイルが含まれる。例えば、cat、cp、ls、more、tarなどの実行ファイル。
/boot	Linuxのカーネルやブートマネージャーなどが含まれる。このディレクトリにはブートプロセスの間に必要なファイルだけが置かれる。
/dev	物理デバイスを参照しているコンピューターに接続されたデバイス(マウスやキーボード、ディスク等)のスペシャルファイルやデバイスファイルの置き場所。
/etc	ほとんどのシステム設定ファイルが入っているディレクトリ。また、サブディレクトリの/etc/rc.dには初期化スクリプトが入っている。
/lib	システムの起動時に必要な共有ライブラリや、ルートファイルシステムでコマンドを実行するのに必要な共有ライブラリがおかれる場所。
/media	CD-ROMやフロッピーディスクなどの外付けメディア用のマウントポイント。
/mnt	一時的にマウントされるファイルシステムのマウントポイント。
/opt	アドオンパッケージの静的なファイルが置かれる。
/run	実行中のプロセスに関連するデータが置かれる。
/sbin	/bin と同様に、このディレクトリにはシステムの起動に必要なコマンドが含まれる。ただしここには、一般ユーザーは通常実行しないコマンドが置かれる。
/srv	定期的なジョブによって、またはシステム起動時に、無条件に削除して構わない一時的なファイルが置かれる。
/tmp	定期的なジョブによって、またはシステム起動時に、無条件に削除して構わない一時的なファイルが置かれる。
/usr	ユーザが独自にインストールするファイル類がおかれる。ルート直下と同様の構造が作成されている。
/var	スプールファイルやログファイルのような、サイズが変化するファイルが置かれる。

実際に以下のコマンドをUbuntuでたたいてみると下のようなディレクトリ構造が表示される。

tree -d -L 2

#発展編
ここではルートディレクトリ直下のディレクトリ(オプション含む)について詳しく解説する。
###/bin：必須のユーザーコマンドバイナリを置いている
システム管理者とユーザーの両方が使用できるコマンドが含まれる。
他のファイルシステムがマウントされていない場合（シングルユーザーモードなど）に必要。また、スクリプトによって間接的に使用されるコマンドが含まれる場合もある。

コマンドがうまく動かなくなったりするので、サブディレクトリを作ってはいけない。

以下のコマンドを保存している。

コマンド	説明
cat	ファイルを標準出力に連結するユーティリティ
chgrp	ファイルグループの所有権を変更するユーティリティ
chmod	ファイルのアクセス許可を変更するユーティリティ
chown	ファイルの所有者とグループを変更するユーティリティ
cp	ファイルとディレクトリをコピーするユーティリティ
date	システムデータと時刻を印刷または設定するユーティリティ
dd	ファイルを変換してコピーするユーティリティ
df	ファイルシステムのディスク容量使用量を報告するユーティリティ
dmesg	カーネルメッセージバッファを印刷または制御するユーティリティ
echo	テキスト行を表示するユーティリティ
false	偽。何もしないユーティリティ
hostname	システムのホスト名を表示または設定するユーティリティ
kill	プロセスに停止のシグナルを送信するユーティリティ
ln	ファイル間のリンクを作成するユーティリティ
login	システムでセッションを開始するユーティリティ
ls	ディレクトリの内容を一覧表示するユーティリティ
mkdir	ディレクトリを作成するユーティリティ
mknod	ブロックまたは文字の特殊ファイルを作成するユーティリティ
more	テキストをページングするユーティリティ
mount	ファイルシステムをマウントするユーティリティ
mv	ファイルを移動/名前変更するユーティリティ
ps	プロセスステータスを報告するユーティリティ
pwd	現在の作業ディレクトリの名前を出力するユーティリティ
rm	ファイルまたはディレクトリを削除するユーティリティ
rmdir	空のディレクトリを削除するユーティリティ
sed	「sed」ストリームエディタ
sh	POSIX互換のコマンドシェル
stty	端末回線設定を変更および印刷するユーティリティ
su	ユーザーIDを変更するユーティリティ
sync	ファイルシステムバッファをフラッシュするユーティリティ
true	真。何もしないユーティリティ
umount	ファイルシステムをアンマウントするユーティリティ
uname	システム情報を印刷するユーティリティ

###/boot：ブートローダーの静的ファイルを置いている
起動時に不要な設定ファイルとマップインストーラを除いて、起動プロセスに必要なすべてが置いてある。したがってカーネルがユーザーモードプログラムの実行を開始する前に使用されるデータも格納されており、保存されたマスターブートセクターとセクターマップファイルが含まれる場合がある。

ブートローダーがファイルを起動できるようにするために必要なプログラムは、/sbinに配置されている。また起動時に不要なブートローダーの構成ファイルは、/etcに配置されている。

###/dev：デバイスファイルを置いている
特に深掘りすることなし。

###/etc：ホスト固有のシステム構成ファイルを置いている
システム構成ファイルは、プログラムの動作を制御するために使用されるローカルファイル。静的である必要があり、実行可能なバイナリにすることはできない。
ちなみに/etcにシステム構成ファイルを置く場合は直下ではなく、サブディレクトリに保存するのが普通。

/etc対応するサブシステムがインストールされている場合は以下のようなディレクトリが作られ、中に設定ファイルが保存される。(またはディレクトリへのシンボリックリンクがある。)

ディレクトリ	説明
/etc/opt	Cシェルログイン用のシステム全体の初期化ファイル
/etc/X11	NFSファイルシステムのアクセス制御リスト
/etc/sgml	ファイルシステムに関する静的情報
/etc/xml	XML の設定ファイル群が置かれるディレクトリ

また/etc対応するサブシステムがインストールされている場合は、次のファイルが/etcに保存される。(またはディレクトリへのシンボリックリンクがある。)

ファイル	説明
csh.login	Cシェルログイン用のシステム全体の初期化ファイル
exports	NFSファイルシステムのアクセス制御リスト
fstab	ファイルシステムに関する静的情報
ftpusers	FTPデーモンのユーザーアクセス制御リスト
gateways	ルーティングされたゲートウェイをリストするファイル
gettydefs	gettyが使用する速度と端末の設定
group	ユーザーグループファイル
host.conf	リゾルバー構成ファイル
hosts	ホスト名に関する静的情報
hosts.allow	TCPラッパーのホストアクセスファイル
hosts.deny	TCPラッパーのホストアクセスファイル
hosts.equiv	rlogin、rsh、rcpの信頼できるホストのリスト
hosts.lpd	lpdの信頼できるホストのリスト
inetd.conf	inetdの構成ファイル
inittab	initの構成ファイル
issue	ログイン前のメッセージと識別ファイル
ld.so.conf	共有ライブラリを検索するための追加ディレクトリのリスト
motd	その日のファイルのログイン後のメッセージ
mtab	ファイルシステムに関する動的情報
mtools.conf	mtoolsの構成ファイル
networks	ネットワーク名に関する静的情報
passwd	パスワードファイル
printcap	lpdプリンター機能データベース
profile	shシェルログイン用のシステム全体の初期化ファイル
protocols	IPプロトコルリスト
resolv.conf	リゾルバー構成ファイル
rpc	RPCプロトコルリスト
securetty	rootログインのTTYアクセス制御
services	ネットワークサービスのポート名
shells	有効なログインシェルのパス名
syslog.conf	syslogdの構成ファイル

###/home：ユーザーのホームディレクトリ（オプション）
特に深掘りすることなし。

###/lib：必須の共有ライブラリとカーネルモジュールを置いている
システムを起動し、ルートファイルシステムでコマンドを実行するのに必要な共有ライブラリが置かれている。
以下のようなファイルが置かれる。

ファイル	説明
libc.so.*	動的にリンクされたCライブラリ
ld*	実行時リンカー/ローダー

/lib対応するサブシステムがインストールされている場合は、以下のようなディレクトリが作られ、中にモジュールが保存される。(またはディレクトリへのシンボリックリンクがある。)

ディレクトリ	説明
modules	ロード可能なカーネルモジュール

###/media：リムーバブルメディアのマウントポイント
フロッピーディスク、CD-ROM、zipディスクなどのリムーバブルメディアのマウントポイントとして使用されるサブディレクトリが置かれている。

/media対応するサブシステムがインストールされている場合は、以下のようなディレクトリが作られ、中にモジュールが保存される。(またはディレクトリへのシンボリックリンクがある。)

ディレクトリ	説明
floppy	フロッピードライブ
cdrom	CD-ROMドライブ
cdrecorder	CDライター
zip	Zipドライブ
iso	isoドライブ

###/mnt：一時的にマウントされたファイルシステムのマウントポイント
特に深掘りすることなし。

###/opt：アドオンアプリケーションソフトウェアパッケージを置いている
アドオンアプリケーションソフトウェアパッケージのインストール用に予約されているディレクトリ。
ディレクトリの構成は/opt/bin、/opt/docｍ、/opt/include、 /opt/info、/opt/lib、および /opt/man。

ユーザーが呼び出すプログラムは、ディレクトリ/opt//binまたは/opt/階層の下に配置する必要がある。
(パッケージにUNIXマニュアルページが含まれている場合は/opt//share/man、/opt/階層内または階層の下に配置すおよび/usr/share/man以下のディレクトリ構造と同じ下部構造にする必要がある。)
またホスト固有の構成ファイルを/etc/optにインストールする必要がある。

可変（通常の操作での変更）のパッケージファイルは、/var/optにインストールする。

###/proc：バーチャルファイルシステム用の特別なディレクトリ
特に深掘りすることなし。

###/root：rootユーザーのホームディレクトリ（オプション）
特に深掘りすることなし。

###/run：実行時変数データを置いている
起動後のシステムを説明するシステム情報データが含まれている。このディレクトリの下のファイルは、起動プロセスの開始時にクリア（必要に応じて削除または切り捨て）される。

###/sbin：システムバイナリファイルを置いている
システム管理に使用されるバイナリに加えて、システムの起動、復元、回復、および/または修復に不可欠なバイナリが置かれている。

コマンドがうまく動かなくなったりするので、サブディレクトリを作ってはいけない。

以下のコマンドを保存している。

コマンド	説明
fastboot	ディスクをチェックせずにシステムを再起動します
fasthalt	ディスクをチェックせずにシステムを停止します
fdisk	パーティションテーブルマニピュレータ
fsck	ファイルシステムのチェックと修復ユーティリティ
fsck.*	特定のファイルシステムのファイルシステムチェックおよび修復ユーティリティ
getty	ゲッティプログラム
halt	システムを停止するコマンド
ifconfig	ネットワークインターフェイスの構成
init	初期プロセス
mkfs	ファイルシステムを構築するコマンド
mkfs.*	特定のファイルシステムを構築するコマンド
mkswap	スワップ領域を設定するコマンド
reboot	システムを再起動するコマンド
route	IPルーティングテーブルユーティリティ
swapon	ページングとスワッピングを有効にする
swapoff	ページングとスワッピングを無効にする
update	ファイルシステムバッファを定期的にフラッシュするデーモン

###/srv：このシステムが提供するサービスのデータを置いている
HTTP、FTPなどのサービス用のデータが入っているディレクトリ。

###/sys：デバイスの情報を置いている
特に深掘りすることなし。

###/tmp：一時ファイルを置いている
一時ファイルを必要とするプログラムのために利用できるように提供されているディレクトリ。

###/usr：大部分のマルチユーザ（全ユーザのための）ユーティリティとアプリケーションを置いている
X Window Systemなどの多くのブログラムがサブディレクトリに格納されている。

ホスト固有の情報や時間の経過に伴い変化する情報は他の場所に保存される（前者は /etc、後者は /var の下）。

以下のようなディレクトリがある。

ディレクトリ	説明
/usr	X Window Systemなどの多くのブログラムがサブディレクトリに格納されている。
/usr/bin	Linuxオペレーティングシステムのコア以外の多くの実行ファイルを置いている。
/usr/include	CやC++などのヘッダーファイルを置いている。
/usr/lib	/usr/bin/ や /usr/sbin/ にある実行ファイルの基本となるライブラリ (library) 群(CやC++などのライブラリファイル)を置いている。
/usr/sbin	基本的でないシステム実行ファイル群(管理用コマンド)を置いている。例えば、各種ネットワークサービス用デーモンなど。
/usr/share	デフォルト設定ファイル、イメージ、ドキュメントなどの共有ファイルを置いている。
/usr/src	Linuxカーネルのソースコードを置いている。例えば、カーネルのソースコードとそのヘッダファイル群など。
/usr/X11R6	X Window System, Version 11 Release 6のアプリケーションが置いてある。
/usr/local	/usrディレクトリと似ていてローカルファイルを置いている。

###/var ：ログ、メール、プリントスプールなどのいろいろなシステムファイルを置いている

以下のようなディレクトリがある。

ディレクトリ	説明
/var	ログ、メール、プリントスプールなどのいろいろなシステムファイルが格納されている。
/var/cache	アプリケーションのキャッシュデータを置いている。
/var/lib	アプリケーションのステータスに関する情報を置いている。
/var/lock	二重起動などをチェックするロックファイルを置いている。
/var/log	ログファイルを置いている。
/var/mail	ユーザの電子メールデータを置いている。
/var/opt	/optｄｈディレクトリにあるパッケージのデータを置いている。
/var/run	起動してからのシステムデータを置いてある。
/var/spool	プロセス待機中のデータを置いている。
/var/tmp	システムリブート用の一時ファイルを置いている。

#参考にした、参考になるサイト