CodeIQさんの問題に、いつもPython使ってるのでたまにはC++を、と思ったらハマったのだけど。
原因がようやく分かった。std::cinでの読み込みが失敗していた。失敗しても例外とか投げずに静かに失敗するので、分からないんですね。

例：整数のみからなるテキストがstdinに渡される、としよう。行数は、前もって分からない。
これをvectorに読み込みたい。

よくない例

#include <iostream>
#include <vector>

int main(){
    int t;
    std::vector<int> v;

    while(!std::cin.eof()){
        std::cin >> t;
        v.push_back(t);
    }
    for(auto it=v.begin();it!=v.end();++it){
        std::cout << *it << std::endl;
    }
}

普通に、このように書いて、以下のように入力したら。

stdinにこれを入力

1
2
3

こうなった。

実行結果

原因は、空行を整数として解釈しようとして、できなかったので、tを何も変更しなかったことと思われる。

改善

int main(){
    int t;
    std::vector<int> v;

    while(!std::cin.eof()){
        std::cin >> t;
        if(std::cin.fail()) break;  // エラーチェックを付け加えた
        v.push_back(t);
    }
    for(auto it=v.begin();it!=v.end();++it){
        std::cout << *it << std::endl;
    }
}

こうしたら、3がダブらずに済む。
せっかくwhileの中にループ抜ける条件書いてるのに・・・・

ちなみに、整数ではなく間違えて文字を入力してしまったときは、tには0が入力され、また、
std::cin.clear()でエラーをクリアし、std::cin.ignore()で読み捨てないといけないみたい。

お手軽にできるのかと思いきや、結構めんどくさいのですね。