2
1

Delete article

Deleted articles cannot be recovered.

Draft of this article would be also deleted.

Are you sure you want to delete this article?

More than 5 years have passed since last update.

このページではTrinityを動かすために必要なソフトウェアであるJellyfishのインストール方法を記載しています。

Jellyfishとは

k-merカウントを行うツールです。

事前準備

ホームディレクトリ直下(~/)にsrcとbinを作っておきます。

/src...パッケージ等を解凍したものの置き場所。
/bin...実行ファイル置き場。

のように置き場所を決めておくと便利です。

インストール

適当な場所にjellyfish-2.2.10.tar.gzをダウンロードします。

wget https://github.com/gmarcais/Jellyfish/releases/download/v2.2.10/jellyfish-2.2.10.tar.gz

注意: Trinityを動かすにはJellyfish version 2以降が必要です。

以下のコマンドで解凍します。

tar xvzf jellyfish-2.2.10.tar.gz

解凍したものを~/srcディレクトリに配置します。

mv jellyfish-2.2.10 ~/src/

~/src配下に置いたTrinityのインストールディレクトリに移動します。

cd ~/src/jellyfish-2.2.10

configureを行います。その時、自分のホームディレクトリにインストールされるようにオプションをつけます。

./configure --prefix=$HOME

makeを行います。

make

これでインストール完了です。

2
1
0

Register as a new user and use Qiita more conveniently

  1. You get articles that match your needs
  2. You can efficiently read back useful information
  3. You can use dark theme
What you can do with signing up
2
1

Delete article

Deleted articles cannot be recovered.

Draft of this article would be also deleted.

Are you sure you want to delete this article?