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JupyterLab上でmatplotlibのアニメーションを出力する

Posted at 2019-04-14

JupyterLabを使っているとmatplotlibで作成したアニメーションをnotebook上で再生できず困っていたのですが、
解決方法が分かったので共有します。

環境

$ sw_vers
ProductName:	Mac OS X
ProductVersion:	10.13.6
BuildVersion:	17G65
$ python -V
Python 3.6.8 :: Anaconda, Inc.
$ jupyter lab --version
0.35.3
$ python -c "import matplotlib; print(matplotlib.__version__)"
3.0.0

解決方法

方法1: IPython.display.HTMLを使う

後の方法2よりもこちらのほうが簡単で良いと思います。

以下は確認用のコードです。jupyter labを起動させて下のコードを貼り付けてアニメーションが表示されるか試すことができます。

import numpy as np
import matplotlib.pyplot as plt
from matplotlib.animation import FuncAnimation
from IPython.display import HTML

fig, ax = plt.subplots()
xdata, ydata = [], []
ln, = plt.plot([], [], 'ro')

def init():
    ax.set_xlim(0, 2 * np.pi)
    ax.set_ylim(-1, 1)
    return ln,

def update(frame):
    xdata.append(frame)
    ydata.append(np.sin(frame))
    ln.set_data(xdata, ydata)
    return ln,

ani = FuncAnimation(fig, update, frames=np.linspace(0, 2 * np.pi, 128),
                    init_func=init, blit=True, interval=50)

HTML(ani.to_jshtml())
# HTML(ani.to_html5_video())  # またはこちら

出力結果：

to_jshtml()によりアニメーションをHTML表現に変換したものをHTML()で表示させています。ボタンによるインタラクティブな操作ができていい感じです。
to_html5_video()でHTML5 video tagを作成することもできます。

方法2: jupyter-matplotlibを使う

参考までに、別の方法も載せておきます。

jupyter-matplotlibをインストールし、%matplotlib widgetのmagic commandを実行することでも解決できました。
自分がインストールしたバージョンはv0.3.0です。

実行したコマンド：

conda install -c conda-forge ipympl
# conda install nodejs  # 必要なら
jupyter labextension install @jupyter-widgets/jupyterlab-manager
jupyter labextension install jupyter-matplotlib

コード：

import numpy as np
import matplotlib.pyplot as plt
from matplotlib.animation import FuncAnimation

%matplotlib widget

fig, ax = plt.subplots()
xdata, ydata = [], []
ln, = plt.plot([], [], 'ro')

def init():
    ax.set_xlim(0, 2 * np.pi)
    ax.set_ylim(-1, 1)
    return ln,

def update(frame):
    xdata.append(frame)
    ydata.append(np.sin(frame))
    ln.set_data(xdata, ydata)
    return ln,

ani = FuncAnimation(fig, update, frames=np.linspace(0, 2 * np.pi, 128),
                    init_func=init, blit=True, interval=50)

notebookに以下のようなアニメーションが出力されていれば成功です。

補足

作成したアニメーションを保存するときは、例えばこんな感じで。下のコードを実行するには事前にimagemagickをインストールしておく必要があります。

ani.save('anim.gif', writer='imagemagick', fps=10)

参考

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