前提

AmazonLinux2(EC2)
JDK1.8.0
MySQL 8.0
構成管理はGradle 6.0
こちらでEC2、RDSによるアプリケーションサーバー環境を構築済み。なお、当初EC2インスタンスをmicroにしていたが、メモリ不足でビルドが失敗したのでmediumにした。
こちらでTomcatとJDKをインストール済み。今回はApacheは使わずとりあえずTomcatのみで動かす。
プロジェクトはGitHubからcloneする。

Springを実行するクラスにwarデプロイ用記述を追加

プロジェクトを作成したとき、自動でSpringを実行するクラスが作成されていると思う（@SpringBootApplicationアノテーションがついているクラス）。
ここにwarとしてデプロイ可能にするための記述をする。Spring公式を参照した。

@SpringBootApplication
public class Application extends SpringBootServletInitializer {

    @Override
    protected SpringApplicationBuilder configure(SpringApplicationBuilder application) {
        return application.sources(Application.class);
    }

    public static void main(String[] args) throws Exception {
        SpringApplication.run(Application.class, args);
    }

}

Gradleの設定とビルド

Gradleの設定

war作成用の設定をする。archiveFileNameはwarの名前となる。archiveNameにしていたら、非推奨とのメッセージが出た。Gradle7.0からはこれだと動かなくなるそう。
SpringBoot組み込みTomcatが、EC2上のものと競合しないよう設定
ほかに、自分の場合はSeleniedによる画面テストコードもプロジェクトに含めていたので、これを除外する設定をtest内に記述した。

plugins {
    id 'org.springframework.boot' version '2.2.4.RELEASE'
    id 'io.spring.dependency-management' version '1.0.9.RELEASE'
    id 'java'
    id 'war'
}

// ~省略~

war {
    enabled = true
    archiveFileName = 'sample.war'
}

dependencies {
    // ~省略~
    providedRuntime 'org.springframework.boot:spring-boot-starter-tomcat'
}

test {
    // ~省略~
    exclude 'com/example/demo/ViewTest.class'
}

EC2上でビルド

ホームディレクトリにWEBアプリのプロジェクトをgit cloneしておく。
プロジェクト内のapplication.propertiesにRDSの設定を反映させておく。

プロジェクトのapplication.propertiesがあるディレクリにて

$ sudo vim application.properties

application.properties

spring.datasource.url=jdbc:mysql://RDSのエンドポイント:3306/データベース名?serverTimezone=JST
spring.datasource.username=******
spring.datasource.password=***********
spring.datasource.driver-class-name=com.mysql.cj.jdbc.Driver
spring.jpa.open-in-view=true
#~省略~

gradlew buildコマンド実行。buildが成功すると、project名/build/libs内にsample.warが生成される。
まだ分かっていないところがあるが、project名-0.0.1-SNAPSHOT.warというwarも生成されていた（sample.warと中身は同じ？）。

プロジェクトのディレクトリにて

$ ./gradlew build

生成されたwarをTomcatへ配備

tomcat/webapps配下へsample.warをコピーする。※自分の場合は/opt/tomcat-9/webappsに配備。

$ cp sample.war /opt/tomcat-9/webapps/

Tomcat再起動

$ sudo systemctl restart tomcat

↓のようにアクセスするとアプリが動く。
http://EC2のエンドポイント:8080/sample/作成アプリに応じたリクエスト先