藤田眞作氏の縦組パッケージは使い勝手が良いのだけれども、LuaLaTeXではそのまま使えないので、これを修正する方法を示す。

zw あるいは zh となっているところを、それぞれ、\zw、 \zh と書き換える
\kanjiskipとなっているところを、\ltjsetparameter{}で囲む
\xkanjiskipとなっているところを、\ltjsetparameter{}で囲む

たとえば、\xkanjiskip=\kanjiskipとなっている場合には、
\ltjsetparameter{xkanjiskip=\ltjgetparameter{kanjiskip}}
とする。
\smash{...}となっているところを、\hbox{\smash{...}}とする

以上

補足；

\ltjsetparameter{} とは、LuaTeX-ja（LuaTeXをベースにした日本語組版拡張）のパラメータを設定するためのコマンドである。概要はつぎのとおり。

LuaTeX-ja は、LuaTeXに日本語組版機能を追加した拡張で、従来のpTeX系とは異なる方法で日本語組版を実現してる。\ltjsetparameter{} は、LuaTeX-jaの組版パラメータを調整するためのコマンドである。引数にパラメータ名と値を指定して、組版の挙動（字間や禁則処理、縦横の設定など）を変更することができる。

使い方
\ltjsetparameter{kanjiskip=0.3zw}

これは、漢字間の字間（kanjiskip）を「0.3zw」に設定する例である。ほかにも
xkanjiskip（漢字と異種文字間の字間）
prebreakpenalty（行頭禁則のペナルティ）
postbreakpenalty（行末禁則のペナルティ）
autospacing（自動字間調整の有効・無効）
などがある。

\kanjiskipと\xkanjiskipについて

日本語組版では、漢字（全角文字）と英数字（半角文字）が混在するため、文字間のスペース（字間）を調整する必要がある。これを「字間調整」と呼ぶ。

\kanjiskip は、漢字と漢字の間に挿入されるスペース（漢字間の字間）を表すパラメータであり、\xkanjiskip は、漢字と英数字・記号などの異種文字との間に挿入されるスペース（異種文字間の字間）を表すパラメータである。そして、

\xkanjiskip=\kanjiskip

とは、「漢字と異種文字の間の字間（\xkanjiskip）を漢字同士の字間（\kanjiskip）と同じ値に設定する」という意味である。

注意
藤田眞作氏の縦組パッケージは、Copyright xxxx by Shinsaku Fujita. All right reserved.　とのみ記載されており、改編についての一切の記載がない。コードが公開されている以上、これらのコードを私的利用の範囲（個人が家庭内や業務上限られた範囲で使う）で改編することは容認されるはずであるが、これを公開することには著作権上の問題がある。この点に注意する必要がある。