GKEの中で永続ディスク（Persistent Disk）の利用方法

Last updated at 2022-01-09Posted at 2019-11-23

GKE使用時の課題

どうやって、Podsの間にデータファイルを共有し、利用出来るか？
どんな時に、Podがエラーとなったり、削除されたり、データに影響があるのか？

上記の課題は、Cloud Storageなどのストレージサービスを利用したら解決できますが、処理パフォーマンスが必要な場合Persistent Diskを利用しなければなりません。

Persistent Diskを使う方法を紹介いたします。

実施手順

Persistent Disk作成
Persistent Diskフォーマット
準備できたPersistent Diskを使ってGKE中にストレージを作成
GKEのストレージマウントのPod作成

※本手順はGCPやgcloudを利用する経験がある前提とします。

１．Persistent Disk作成

# Persistent Disk作成
gcloud compute disks create --size=10GB --zone=asia-northeast1-b sample-gce-nfs-disk

注意：利用されるGKEクラスタのZoneと同じ指定をしてください。

２．Persistent Diskフォーマット

本記事は、GCEを使ってディスクをフォーマット化(初期化)する方法を紹介します。

# Persistentディスク付けのインスタンスを作成する
gcloud compute instances create work-vm --zone=asia-northeast1-b \
      --machine-type=f1-micro  --disk=name=sample-gce-nfs-disk

# GCEインスタンスにSSHする
gcloud compute ssh --zone=asia-northeast1-b work-vm

# 付けるディスク確認
$ sudo lsblk
> NAME   MAJ:MIN RM SIZE RO TYPE MOUNTPOINT
> sda      8:0    0  10G  0 disk 
> `-sda1   8:1    0  10G  0 part /
> sdb      8:16   0  10G  0 disk 

# sdbは下記のコマンドに入れて、フォーマットする
sudo mkfs.ext4 -m 0 -F -E lazy_itable_init=0,lazy_journal_init=0,discard /dev/sdb

# フォーマットはこれで完了です。これからのコマンドの実施は任意
# マウント先のフォルダを作成
sudo mkdir -p /mnt/disks/sdb

# マウント実施
sudo mount -o discard,defaults /dev/sdb /mnt/disks/sdb

# 全てユーザに読み書きげ権限付与
sudo chmod a+w /mnt/disks/sdb

３．準備できたPersistent Diskを使ってGKE中にストレジを作成

ワークフォルダの構成

persistentvolume
├── README.md
├── postgres.deployment.yaml
└── pvc-demo.yaml

定義Yamlファイルを準備します。

pvc-demo.yaml

apiVersion: v1
kind: PersistentVolume
metadata:
  name: sample-volume-pv
spec:
  storageClassName: ""
  capacity:
    storage: 10G
  accessModes:
    - ReadWriteOnce
  gcePersistentDisk:
    pdName: sample-gce-nfs-disk
    fsType: ext4
---
apiVersion: v1
kind: PersistentVolumeClaim
metadata:
  name: sample-volume-pvc
spec:
  accessModes:
    - ReadWriteOnce
  resources:
    requests:
      storage: 10G

accessModesについては下記の３つがあります。

ReadWriteOnce：読み書きできる１つマウント
ReadOnlyMany：読み込み専用の権限で複数マウント可能
ReadWriteMany：読み書きできる複数マウント。GCEのPersistent Diskはこのオプションを適用できない。このオプションを利用したい場合、別の記事でNFSでマウントする方法を紹介します。

GKE中のストレージを作成

＃　ストレージ作成実施
kubectl apply -f pvc-demo.yaml

GKEのストレージ確認

４．GKEのストレジマウントのPod作成

postgres.deployment.yaml

apiVersion: extensions/v1beta1
kind: Deployment
metadata:
  name: postgres
spec:
  replicas: 1
  template:
    metadata:
      labels:
        app: postgres
    spec:
      containers:
      - name: postgres
        image: postgres:latest
        imagePullPolicy: "IfNotPresent"
        ports:
        - containerPort: 5432
        env:
        - name: POSTGRES_USER
          value: postgres
        - name: POSTGRES_PASSWORD
          value: magicPass
        - name: PGDATA
          value: /var/lib/postgresql/data/pgdata
        volumeMounts:
        - mountPath: /var/lib/postgresql/data
          name: postgres-volume
      volumes:
      - name: postgres-volume
        persistentVolumeClaim:
          claimName: sample-volume-pvc

このデプロイメント定義は作成したPersistent Diskを使って、データベースの物理ファイルを保存する。

デプロイPostgres

＃　deploy postgres on gke
kubectl apply -f postgres.deployment.yaml

デプロイ後の確認

５．Persistent Disk機能の確認

確認手順

Postgresの中にテーブル作成
Postgresのデプロイを削除
Postgresを再デプロイ（以前のPersistent Disk付き）
作成したテーブルの確認

Postgresの中にテーブル作成

# Podリスト表示
kubectl get pods
> NAME                                               READY   STATUS      RESTARTS   AGE
> nfs-server-c6d9c8755-pvjlz                         1/1     Running     0          147m
> postgres-55d84bc864-nwmgh                          1/1     Running     0          113s

# SSH to pod
kubeclt exec -it postgres-55d84bc864-nwmgh /bin/bash

# Connect to Postgres
psql --host=localhost --user=postgres

# Create a table
sql > CREATE TABLE account(
   user_id serial PRIMARY KEY,
   username VARCHAR (50) UNIQUE NOT NULL,
   password VARCHAR (50) NOT NULL,
   email VARCHAR (355) UNIQUE NOT NULL,
   created_on TIMESTAMP NOT NULL,
   last_login TIMESTAMP
);

sql > \d account;
                                           Table "public.account"
   Column   |            Type             | Collation | Nullable |                 Default                  
------------+-----------------------------+-----------+----------+------------------------------------------
 user_id    | integer                     |           | not null | nextval('account_user_id_seq'::regclass)
 username   | character varying(50)       |           | not null | 
 password   | character varying(50)       |           | not null | 
 email      | character varying(355)      |           | not null | 
 created_on | timestamp without time zone |           | not null | 
 last_login | timestamp without time zone |           |          | 
Indexes:
    "account_pkey" PRIMARY KEY, btree (user_id)
    "account_email_key" UNIQUE CONSTRAINT, btree (email)
    "account_username_key" UNIQUE CONSTRAINT, btree (username)
    
sql > \q;

# exit ssh
exit

Postgresのデプロイ削除

kubectl delete deployment postgres

Postgresを再デプロイ

＃　deploy postgres on gke
kubectl apply -f postgres.deployment.yaml

作成したテーブルの確認

# Podリスト表示
kubectl get pods
> NAME                                               READY   STATUS      RESTARTS   AGE
> nfs-server-c6d9c8755-pvjlz                         1/1     Running     0          147m
> postgres-55d84bc864-fpsv5                          1/1     Running     0          113s

# SSH to pod
kubeclt exec -it postgres-55d84bc864-fpsv5 /bin/bash

# Connect to Postgres
psql --host=localhost --user=postgres

-- 以前作成したテーブルの確認
sql > \d account;
                                           Table "public.account"
   Column   |            Type             | Collation | Nullable |                 Default                  
------------+-----------------------------+-----------+----------+------------------------------------------
 user_id    | integer                     |           | not null | nextval('account_user_id_seq'::regclass)
 username   | character varying(50)       |           | not null | 
 password   | character varying(50)       |           | not null | 
 email      | character varying(355)      |           | not null | 
 created_on | timestamp without time zone |           | not null | 
 last_login | timestamp without time zone |           |          | 
Indexes:
    "account_pkey" PRIMARY KEY, btree (user_id)
    "account_email_key" UNIQUE CONSTRAINT, btree (email)
    "account_username_key" UNIQUE CONSTRAINT, btree (username)
    
sql > \q;

# exit ssh
exit

本記事の利用ソースコードはこちら
https://github.com/dssolutioninc/dss_gke/tree/master/persistentvolume

最後まで読んで頂き、どうも有難う御座います!
DSS 橋本

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