Lost connection to MySQL server during query

Flask-SQLAlchemyでMySQLを使っていてハマった事象について。

発生事象

Flaskアプリケーションを起動して長時間（８時間くらい？）経過後にブラウザでアクセスするとInternal Server Error。エラーログは下記の内容。

sqlalchemy.exc.OperationalError: (pymysql.err.OperationalError) (2013, 'Lost connection to MySQL server during query')

Internal Server Error発生後、ブラウザで再読み込みするとエラーは解消される。
が、さらに長時間経過すると再び同様のエラーが発生。

環境

• Python 3.9.5
• MySQL 5.7.34
• Flask 2.0.0
• Flask-SQLAlchemy 2.4.4
• PyMySQL 1.0.2

原因と対策

どうやら長時間経過するとコネクションプールが死んでしまう模様。
これを解消するにはDBアクセスの前にpingを飛ばしてやる、すなわち SELECT 1 のような特に何もしないSQLを投げてコネクションプールを復活させてやればＯＫ。

この方法はSQLAlchemyの機能として提供されており、デフォルトでは使用しない設定となっている。
create_engine の引数に pool_pre_ping=True を渡せとのことだったが、A Minimal Applicationをどう改修したらいいものやら、いろいろ試した結果以下の方法に落ち着いた。

flask_app.py（抜粋）

app = Flask(__name__)
app.config['SQLALCHEMY_ENGINE_OPTIONS'] = {
    'pool_pre_ping': True
}

とりあえず長時間経過してもエラーは出なくなった。

わからないこと

• MySQL以外のDBMSでは発生しないのか？