rootlessを解除から
El Capitanになって、「rootless」というシステム領域を保護する状態が基本になりました。そのおかげでTotal Finderなどのアプリは使えなくっています。
まずはリカバリモード（⌘+Rを押しながらOSを起動）
リカバリモードでターミナルを開いて下記を実行すると、rootlessが解除されるので、その後は再起動。これで色々とできるようなります。
csrutil disable
ディスクユーティリティからFirst Aidを実行
外付けHDDに対してFirst Aidを実行することでアクセス権周りの修復が実行されます。
外付けHDDの所有権を無視
外付けHDDに対して⌘+Iでインスペクタを表示させます。ウインドウ下部に「このボリューム上の所有権を無視」というオプションがあるのでチェックを入れます。
そうすると「共有とアクセス権」セクションでeveryoneを変更できるようになります。「読み／書き」に変更することでアクセスできるようになります。
chmod +w などしても無駄だった
上記手順を実施する前、/Volumesからchmodなどで権限をいじってもどうになりませんでした。