フィールドはスカラやenumではなく、繰り返しメッセージにする

一般的に拡張していくと、単一の繰り返しフィールドが複数の関連する繰り返しフィールドへ足し算されていくかと思いますが、これはよくありません。

繰り返しメッセージから始めると、拡張性がよくなります。

// Describes a type of enhancement applied to a photo
enum EnhancementType {
  ENHANCEMENT_TYPE_UNSPECIFIED;
  RED_EYE_REDUCTION;
  SKIN_SOFTENING;
}

message PhotoEnhancement {
  optional EnhancementType type;
}

message PhotoEnhancementReply {
  // Good: repeated message で定義しておくと、後からフィールド追加できたり
  // enum より拡張性が高い
  repeated PhotoEnhancement enhancements;

  // Bad: もしパラメーター追加したい場合は、同じように repeated hogeType を追加するか（ひどい）
  // このフィールドを非推奨にして繰り返しメッセージを導入する必要がある。
  repeated EnhancementType enhancement_types;
}

これは map にも同様に適用されます。 map<string, string> よりは map<string, MyProto> にしておくとよいでしょう。

例外として、レイテンシクリティカルなアプリケーションでは、プリミティブ型の並列配列は、単一のメッセージ配列よりも高速です。