現象
OSをCatalinaにアップデートした際に、Karabiner-Elementsがきちんと動作しなくなった
解決策
アプリを起動すると以下のようなアラートが発生するのでこれに従う

システム環境設定 > セキュリティとプライバシー > 入力監視 まで進む
鍵をクリック、パスワードを入力したら、編集ができるようになります。

[+]ボタンで、必要なファイルを追加する。右上の検索から探した方が早いと思います。
karabiner_grabber

この3つを追加すると下図のようになります。鍵をかけた後、再起動すると、きちんと動作するかと思います。
同様の現象(gyazo)
gyazoでも同じようなことが発生しているので、設定で変更してあげましょう。
https://qiita.com/bbapexx/items/34e5797d2ff9c72bf6b0