最近helmの更新で，公式にmigemo検索が導入されたようだ。
https://github.com/emacs-helm/helm/wiki#use-migemo-in-helm
M-x helm-migemo-mode，もしくは設定ファイルに(helm-migemo-mode 1)を追記することで以下がmigemo検索の対象となる。

kill ring
occur, moccur
buffers
helm-find-files (One space after a current path is needed to get candidates via migemo.)
Files in current directory
file name history (C-c h in helm-find-files)
recentf
minibuffer history
bookmarks
filtered bookmarks

helm-migemoをインストールせずともmigemo検索が使える，この事実が重要である。
例えばhelm-occurの情報源（source）が定義されているhelm-regexp.elを見れば分かるとおり、情報源はある一定のフォーマットで記述する必要があるらしい。
syohex氏の以下のブログ記事は参考になるだろう：

migemo対応の helm sourceを書く(helm-migemo不要)

##追記
現在helm-migemoの本体はemacs-jpに移されたようである。
https://github.com/emacs-jp/helm-migemo

##追記２
helm-swoopについてもhelm-migemo-modeへの対応がなされたようである。
https://github.com/ShingoFukuyama/helm-swoop/commit/0ef60eba8304c98d787aa823e9303da31dd52f15