TL;DL
電波天文学のソフトウェア CASA がpythonのモジュールとしてimportできるようになったので、Ubuntu 20.04に導入しようとしたが、色々面倒臭かったので、後の遭難者のために記事にまとめておきます。
注：CASAは公式にはUbuntuをサポートしていません。
準備
pipenvで管理したいのでpipenvを導入しておく。
参考: Ubuntu18.04にPython3.8 + Pipenv環境を構築
Ubuntuのpython version管理はupdate-alternativesが便利。デフォルトをpython3.6にしておく。
参考: UbuntuでPythonのバージョンを変更する方法
libgfortran3の導入
CASA 6.1 (modular)はlibgfortran3が必要だが、Ubuntu 20.04ではサポートされていないため、aptでinstallしようとしても、そんなものはないと言われる。
そこで、libgfortran3の.debファイルを直接ダウンロードしてinstallしようとするが、今度はgcc-6がないと言われる。Ubuntu 20.04ではgcc-9を利用しているので、古いgccを入れる必要があるようだ。
結局、gcc-6-baseの導入 -> libgfortran3の導入でうまくいくことがわかった。
wget http://archive.ubuntu.com/ubuntu/pool/universe/g/gcc-6/gcc-6-base_6.5.0-2ubuntu1~18.04_amd64.deb
wget http://ports.ubuntu.com/pool/universe/g/gcc-6/libgfortran3_6.5.0-2ubuntu1~18.04_arm64.deb
sudo apt install ./gcc-6-base_6.5.0-2ubuntu1~18.04_amd64.deb
sudo apt install ./libgfortran3_6.5.0-2ubuntu1~18.04_arm64.deb
これでlibgfortran3の導入完了です。
pipenvで仮想環境をつくる。
以下のようなPipfileを用意する。
[[source]]
url = "https://pypi.org/simple"
verify_ssl = true
name = "pypi"
[[source]]
url = "https://casa-pip.nrao.edu/repository/pypi-casa-release/simple"
verify_ssl = true
name = "casa"
[packages]
numpy = "*"
pandas = "*"
scipy = "*"
matplotlib = "*"
astropy = "*"
ipython = "*"
casatools = "*"
casatasks = "*"
[dev-packages]
[requires]
python_version = "3.6"
なお、casatoolsとcasatasksのversionを具体的に指定すればpython 3.7でも動くらしい。
(参考: Python 3.7になったGoogle ColabでCASAを動かしてみる)
次に同じディレクトリでpipenvで環境構築。
pipenv install
pipenv run ipython
ipython上でcasatoolsとcasatasksがエラーなくimportできれば成功です。お疲れ様でした。
In [1]: import casatools
In [2]: import casatasks
その他
Ubuntu 20.04に対応しているのはlibgfortran5だが、こちらはCASAのmoduleをimportするときに参照するlibgfortranが3じゃないと怒られてしまう。libgfortran.so.5のシンボリックリンクをlibgfortran.so.3として作るというよくある裏技も試してみたが、やっぱりだめで、どうしても古いlibgfortran3が必要らしい。
追記 (2021/05/01)
並列で走らせようとして、casampi packageを導入しようとしたが失敗。解決したら記事にします...。