python で R のデータセットを使いたい

The pandas.rpy module is deprecated and will be removed in a future version. We refer to external packages like rpy2.
らしいので、rpy2 を使うといいっぽい。

pip install rpy2 で入る。

ipython

In [1]: from rpy2.robjects import pandas2ri

# これをやると rpy2.robjects.vectors.DataFrame から pandas.core.frame.DataFrame に変換してくれる
In [2]: pandas2ri.activate()

In [3]: from rpy2.robjects import r

In [10]: r["iris"].head(10)
Out[10]:
    Sepal.Length  Sepal.Width  Petal.Length  Petal.Width Species
1            5.1          3.5           1.4          0.2  setosa
2            4.9          3.0           1.4          0.2  setosa
3            4.7          3.2           1.3          0.2  setosa
4            4.6          3.1           1.5          0.2  setosa
5            5.0          3.6           1.4          0.2  setosa
6            5.4          3.9           1.7          0.4  setosa
7            4.6          3.4           1.4          0.3  setosa
8            5.0          3.4           1.5          0.2  setosa
9            4.4          2.9           1.4          0.2  setosa
10           4.9          3.1           1.5          0.1  setosa

In [11]: type(r["iris"])
Out[11]: pandas.core.frame.DataFrame

In [12]: type(r["Titanic"])
Out[12]: numpy.ndarray

参考

追記@2016/12/5

rpy2 が

Installing should be as easy* as
pip install rpy2
(*: except on Windows)

とかサラッと無慈悲なので PypeR 使う方法もあるみたいだけど、2012で止まってる気がするけど大丈夫なんだろうか。