１つ目：head要素内。他のstylesheet.cssの参照のように、head要素内に配置します。

２つ目：bodyタグの閉めタグ直前に配置する。（おすすめ）
（理由）
・JavaScriptファイルを読み込んでいる間は、HTMLファイルを読み込まないため、ページのレンダリング(表示）を行わせてからjavascriptファイルを読み込むんでページに動作をつけることで表示速度を早くする。

・CSSはheadタグ中に、javascriptはbodyタグの下にまとめて記述することでわかりやすくなる。