1つ目:head要素内。他のstylesheet.cssの参照のように、head要素内に配置します。
2つ目:bodyタグの閉めタグ直前に配置する。(おすすめ)
(理由)
・JavaScriptファイルを読み込んでいる間は、HTMLファイルを読み込まないため、ページのレンダリング(表示)を行わせてからjavascriptファイルを読み込むんでページに動作をつけることで表示速度を早くする。
・CSSはheadタグ中に、javascriptはbodyタグの下にまとめて記述することでわかりやすくなる。