前提

install pipenv

pythonでのnpmのような管理ツール
brewからinstall

brew install pipenv

Pipfile（とPipfile.lock）をコミットに含める
npmでのpackage.jsonやpackage-lock.jsonのようなものです

work ディレクトリを作成しjupyterとjupytextをinstall

mkdir <directory_name>
cd <directory_name>
pipenv install jupyter jupytext

pipenv run jupyter notebook --generate-configコマンドを実行し、~/.jupyter/jupyter_notebook_config.pyを作成します。
echo 'c.NotebookApp.contents_manager_class = "jupytext.TextFileContentsManager"' >> ~/.jupyter/jupyter_notebook_config.pyコマンドを実行し、Jupytextを利用可能にします。
echo 'c.ContentsManager.default_jupytext_formats = "ipynb,py"' >> ~/.jupyter/jupyter_notebook_config.pyコマンドを実行し、Jupyter NotebookとPythonスクリプトが連動するように設定します。

pipenv run jupyter notebook

ブラウザ上でJupyter Notebookが開く

Jupyter Notebookを起動しているターミナル上でCtrl+Cを押す

nbextesionsはjupyter notebookをカスタマイズするためのもの

pipenv install jupyter-contrib-nbextensions
pipenv install jupyter-nbextensions-configurator

pipenv run jupyter contrib nbextension install --user
pipenv jupyter nbextensions_configurator enable --user

pipenv run jupyter nbextension enable highlight_selected_word/main

ここからは使いたいpackageを以下のようにインストールしていただけば大丈夫です。

pipenv install numpy pandas

npmでの開発に慣れている方にはpipenvでpythonのプロジェクトを作るのは非常にオススメです。
pipenvでのプロジェクトを始めたいときは

pipenv install

でPipfile内にあるpackageがインストールされます。（npm installと同じですね）

以下に実際にやってみたものがあるので、すぐにjupyter notebookを使い始めたい方にどうぞ
https://github.com/YuanzhongLi/python_environment