RでTCCを使いたいのでR最新版をインストールしたら、依存関係からかうまくパッケージをインストールできなかった。
R-3.4.4をインストールしてやることにしたが、パッケージ・インストーラーはどこに?
google chromeのアドレスバーに以下をコピペ(バージョン指定を変えれば、それを落とせる。)
Finderが開くので適当なフォルダを指定して落とす。
まず、現在のバージョンをアンインストール
ターミナルを起動して以下を実行。
sudo rm -rf /Library/Frameworks/R.framework /Applications/R.app
/usr/local/bin/R /usr/local/bin/Rscript
旧バージョンをインストール
落としておいたパッケージ・インストーラーをダブルクリックして、言われるがままにインストール。
アプリケーションフォルダーからRを起動してバージョンを確認
TCCをBioconducterからインストール
Rで以下を実行してパッケージをインストール
source("https://bioconductor.org/biocLite.R")
biocLite("TCC")
無事インストールされた。
解析はこれから。