対策

① Xcodeでコンテナの選択を解除する
② developer.apple.comでコンテナの選択を解除し、保存する

Certificates, Identifiers & Profiles→Identifiersから対象のアプリを選択すれば以下のような画面が現れる。
Editからコンテナの選択を解除できる

③ 2で選択を解除したコンテナを再度選択し、保存する
④ 全く同じコンテナ名でコンテナを作成する（新しくコンテナが作成されるわけではない）
⑤ Xcodeで再度コンテナを選択する

参考