初めに

原因は細かに追求していません。（調べたけどわかりませんでした）
あくまでも解決方法をまとめています。

エラー内容

Railsアプリを新規作成し、諸々初期設定を終え、いざbin/rails sしてブラウザで表示すると、下記のエラー文が表示。
エラー内容は、１.You〜に書いてある通り,webpackerの設定がコンパイルしないようになっていることが原因のよう。

javascript_pack_tagがレイズされてるのはなぜなのか、、。
webpackerでコンパイルしない設定になっているのに、JSをwebpackerでコンパイルする記述になっているから？

Webpacker::Manifest::MissingEntryError
Webpacker can't find application in /Users/"ユーザ名"/app/public/packs/manifest.json.
Possible causes:

You want to set webpacker.yml value of compile to true for your environment unless you are using the webpack -w or the webpack-dev-server.
webpack has not yet re-run to reflect updates.
You have misconfigured Webpacker's config/webpacker.yml file.
Your webpack configuration is not creating a manifest.
Your manifest contains:
{
}

<%= javascript_pack_tag 'application', 'data-turbolinks-track': 'reload' %>

ターミナルにて対象のRailsアプリのディレクトリで下記コマンドを実行

rails webpacker:install
rails webpacker:compile

しかし、解決せず。同様のエラーが発生。

gem 'webpacker', '~> 5.0’　に書き換え

package.json

"dependencies": {
  略
  "@rails/webpacker": "5.4.3"

yarn installする前にyarn.lockを削除。
削除せずにyarn installすると、先ほどの変更が反映されないため。
（yarn.lockを元にyarn installされてしまう。）

3.で行った変更を反映させる。

rails webpacker:install
rails webpacker:compile

webpackerでコンパイルできるようになりました。

本エラーは2回再現されたため、メモとして残す。
せっかくなのでなぜこのエラーが発生するのかまで追求したかったのですが、分からず。

以下調べた内容をまとめる。

Rails6はデフォルトの設定だとSprocketsとWebpackerを併用することにより、アセットファイルのコンパイルを行っている。WebpackerはJavaScriptファイル、Sprocketsはその他のアセット（CSSや画像など）のコンパイル。

今回のエラーはWebpackerでのコンパイルが動作していなかった。