定期実行するバッチ処理をphpで実装すると、けっこうメモリを必要とする処理になりがちです。
そんなときにphp.iniのmemory_limitはそのままに、バッチ実行時だけmemory_limitを増加させたくなります。
マニュアル（ PHP: オプション - Manual ）をみると、-dオプションでphp.iniで設定する各項目を設定できるそうです。
$ php -d memory_limit=256M require_large_memory.php
こんな感じで、memory_limitを増加させてバッチ実行できるようです。
-cオプションを使うとカスタムしたINIファイル指定もできるようですが、そこまでしなくてもちょっとオプション設定するだけでOKってときは、-dオプション使ってみると良いかとおもいます。