message中にプラグイン名や、プラグインのみに記述のあるモデル名があるときしかつかえないけど。
PhoStormの一括置換で
Text to find:を __\('([^()]*PluginName[^()]*)'\)
Replace with: を __d('plugin_name', '$1')
にしてRegular expression有効で置換。
メッセージ中にプラグイン名が出てれば置換対象となる。
個人的に、プラグイン内のモデル名はユニークになるようにプラグイン名をプレフィクスとしてつけてるので、これでOK。
2014/04/21追記
この方法だとカラム名とかはdに置換されないので、結局(を全部__d(に置換するようになりました(^^;