前提

環境はMac
プロジェクトをMavenで管理しており、すでにmaven-javadoc-pluginが導入されていること。

pom.xml

<project>
	…
 		<build>
	  		<plugins>
  				<plugin>
  					<groupId>org.apache.maven.plugins</groupId>
  					<artifactId>maven-javadoc-plugin</artifactId>
      				<version>2.10.4</version>
	  				<configuration>
  						<quiet>true</quiet>
  					</configuration>
  					<executions>
  						<execution>
  							<id>attach-javadocs</id>
      						<goals>
	  							<goal>jar</goal>
  						  	</goals>
  					  	</execution>
  				  	</executions>
      		  	</plugin>
	  	  	</plugins>
   	  	</build>
	…
<project>

Option一覧

そもそもjavadocにはどのようなoptionがあるのだろう？

$ javadoc -help

使用方法: javadoc [options] [packagenames] [sourcefiles] [@files]
  -overview <file>          HTMLファイルから概要ドキュメントを読み込む
  -public                   publicクラスとメンバーのみを示す
  -protected                protected/publicクラスとメンバーを示す(デフォルト)
  -package                  package/protected/publicクラスとメンバーを示す
  -private                  すべてのクラスとメンバーを示す
  -help                     コマンド行オプションを表示して終了する
  -doclet <class>           代替docletを介して出力を生成する
  -docletpath <path>        docletクラス・ファイルを探す場所を指定する
  -sourcepath <pathlist>    ソース・ファイルのある場所を指定する
  -classpath <pathlist>     ユーザー・クラス・ファイルのある場所を指定する
  -cp <pathlist>                   ユーザー・クラス・ファイルのある場所を指定する
  -exclude <pkglist>        除外するパッケージ・リストを指定する
  -subpackages <subpkglist> 再帰的にロードするサブパッケージを指定する
  -breakiterator            BreakIteratorで最初の文を計算する
  -bootclasspath <pathlist> ブートストラップ・クラス・ローダーによりロードされた
                                   クラス・ファイルの場所をオーバーライドする
  -source <release>         指定されたリリースとソースの互換性を提供する
  -extdirs <dirlist>        インストールされた拡張機能の場所をオーバーライドする
  -verbose                  Javadocの動作についてメッセージを出力する
  -locale <name>            en_USやen_US_WINなどの使用するロケール
  -encoding <name>          ソース・ファイルのエンコーディング名
  -quiet                    状態メッセージを表示しない
  -J<flag>                  <flag>を実行時システムに直接渡す
  -X                        非標準オプションの概要を出力し終了する

標準のdocletにより提供されるもの:
  -d <directory>                    出力ファイルの転送先ディレクトリ
  -use                              クラスとパッケージの使用ページを作成する
  -version                          @versionパラグラフを含める
  -author                           @authorパラグラフを含める
  -docfilessubdirs                  doc-fileサブディレクトリを再帰的にコピーする
  -splitindex                       1字ごとに1ファイルに索引を分割する
  -windowtitle <text>               ドキュメント用のブラウザ・ウィンドウ・タイトル
  -doctitle <html-code>             概要ページにタイトルを含める
  -header <html-code>               各ページにヘッダーを含める
  -footer <html-code>               各ページにフッターを含める
  -top    <html-code>               各ページに上部テキストを含める
  -bottom <html-code>               各ページに下部テキストを含める
  -link <url>                       <url>にjavadoc出力へのリンクを作成する
  -linkoffline <url> <url2>         <url2>にあるパッケージ・リストを使用して<url>のdocsにリンクする
  -excludedocfilessubdir <name1>:.. 指定された名前のdoc-filesサブディレクトリをすべて除外する
  -group <name> <p1>:<p2>..         指定するパッケージを概要ページにおいてグループ化する
  -nocomment                        記述およびタグを抑制して宣言のみを生成する
  -nodeprecated                     @deprecated情報を除外する
  -noqualifier <name1>:<name2>:...  出力から修飾子のリストを除外する
  -nosince                          @since情報を除外する
  -notimestamp                      非表示のタイムスタンプを除外する
  -nodeprecatedlist                 非推奨のリストを生成しない
  -notree                           クラス階層を生成しない
  -noindex                          索引を生成しない
  -nohelp                           ヘルプ・リンクを生成しない
  -nonavbar                         ナビゲーション・バーを生成しない
  -serialwarn                       @serialタグに関する警告を生成する
  -tag <name>:<locations>:<header>  単一の引数を持つカスタム・タグを指定する
  -taglet                           タグレットの完全修飾名を登録する
  -tagletpath                       タグレットのパス
  -charset <charset>                生成されるドキュメントのクロスプラットフォームでの文字エンコーディング
  -helpfile <file>                  ヘルプ・リンクのリンク先ファイルを含める
  -linksource                       HTML形式でソースを生成する
  -sourcetab <tab length>           ソース内のタブの空白文字の数を指定する
  -keywords                         HTMLのmetaタグに、パッケージ、クラスおよびメンバーの情報を含める
  -stylesheetfile <path>            生成されたドキュメントのスタイル変更用ファイル
  -docencoding <name>               出力の文字エンコーディングを指定する

  かなりいっぱいありますね(笑)
下記でいくつか抜粋して実際に実行してみます。

実際にoptionを指定して実行してみる

1.上記一覧の`-d <directory>`に対応するタグ`<outputDirectory>`を使って、出力するディレクトリを指定してみる

pom.xml

<build>
	<plugins>
		<plugin>
			<groupId>org.apache.maven.plugins</groupId>
			<artifactId>maven-javadoc-plugin</artifactId>
			<version>2.10.4</version>
			<configuration>
				<quiet>true</quiet>
				<outputDirectory>javadoc/report</outputDirectory>  <!-- ここに記述を追加 -->
			</configuration>
			<executions>
				<execution>
					<id>attach-javadocs</id>
					<goals>
						<goal>jar</goal>
					</goals>
				</execution>
			</executions>
		</plugin>
	</plugins>
</build

対象プロジェクトのディレクトリに移動し下記コマンドを実行

$ mvn install

対象プロジェクト/javadoc/reportにファイルが出力されているのか確認する

$ ls -l

allclasses-frame.html
allclasses-noframe.html
com
constant-values.html
deprecated-list.html
help-doc.html
index-all.html
index.html
overview-frame.html
overview-summary.html
overview-tree.html
package-list
script.js
serialized-form.html
stylesheet.css

ちゃんと出てる！

2.Option一覧の`-bottom`に対応するタグ`<bottom>`を使って、出力されるレポートのコピーライトを任意の文字として出力する

pom.xml

<build>
	<plugins>
		<plugin>
			<groupId>org.apache.maven.plugins</groupId>
			<artifactId>maven-javadoc-plugin</artifactId>
			<version>2.10.4</version>
			<configuration>
				<quiet>true</quiet>
				<bottom><![CDATA[<p class="legalCopy"><small>Copyright &#169; 2016. test-framework.</small></p>]]></bottom>  <!-- ここに記述を追加 -->
			</configuration>
			<executions>
				<execution>
					<id>attach-javadocs</id>
					<goals>
						<goal>jar</goal>
					</goals>
				</execution>
			</executions>
		</plugin>
	</plugins>
</build>

対象プロジェクトのディレクトリに移動し下記コマンドを実行

$ mvn install

対象プロジェクト/javadoc/report/serialized-form.htmlにファイルが出力されているのか確認する

$ cat serialized-form.html

<!-- ======== END OF BOTTOM NAVBAR ======= -->
<p class="legalCopy"><small><p class="legalCopy"><small>Copyright &#169; 2016. test-framework.</small></p></small></p>
</body>
</html>

END OF BOTTOM NAVBARの下にちゃんとコードが反映されている
 ブラウザでも確認
 
   コピーライトが出力されてる！OK 

まとめ

基本的に<configuration>の中に定義をしていく、他のoptionも同じノリで追加できる。
最初にoption指定のコマンド実行で、どういうことをしてくれるのか色々試した後にpom.xmlへ設定の定義を追加すると良さそう！
コマンド実行の方が楽にできるので!
二通りしか紹介できてないので、今後追加していく予定です。

参考

http://maven.apache.org/plugins-archives/maven-javadoc-plugin-2.10.3/
https://maven.apache.org/plugins/maven-javadoc-plugin/usage.html