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元記事：2018/10/16 公開 FASTA status の使い方

　NGS フリーソフトページにて配布中の「FASTA status」の使い方をご説明いたします。

　このソフトは NGS 解析でよく用いられる配列データファイル形式である FASTA ファイルのデータからステータスを計算します。ここでの説明にはソフトの動作テストと同じ環境である Windows10、Java8 の条件で行っております。

起動

　このソフトは Java を使用するため、ご使用のパソコンにインストールされていない場合はインストールをお願い致します。

　ダウンロードした JAR ファイルはダブルクリックで起動できます。起動できなかった場合は次のようにします。

　「Java(TM) Platform SE binary」　一覧にない場合は「その他アプリ」で追加の一覧を開くか、そこにもない場合は「この PC で別のアプリを探す」で Java をインストールしたフォルダから javaw.exe を選択します。

　プログラムの変更が完了したら、適用→OKの順に選択してください。その後はダブルクリックで開きます。

ファイルの指定

　画面は以下のように左の設定領域と、右の結果表示領域にわかれています。

　先ずは設定領域にある「FASTA File」の「Select」ボタンを押してください。ファイル選択のダイアログが開くので、FASTA ファイルを選択して「開く」を押してください。

　ファイルを選択したらファイル名が表示されます。左の設定領域にある「Run」ボタンを押すことで実行が行われます。

　計算が完了すると「Successfully completed.」というダイアログメッセージが表示されます。右の結果表示領域にステータスの表と GC 含量と配列長の相関図が表示されます。

　右の結果表示領域にある「Export」ボタンを押すことでファイル出力ができます。

　開いたダイアログにファイル名を記入し「保存」ボタンを押すことで出力が実行されます。

　ファイルの作成が完了すると「Exporting completed successfully.」というダイアログメッセージが表示されます。

　output.xlsx は以下のように配列ごとのステータスを見ることができます。