##　はまらないという状況は？

見てるとおり、YUKOちゃんがジャンプする時、体にあるコライダーがずれました。

##　なぜコライダーははまらない

原因は上の二つのパラメータ。

キャラモデルは一つのemptyObjectと複数の子物体に構成されています。
Apply Root Motionにチャックを入れると、子物体のモーションが親物体のtransformを影響できます。
Bake into pose　にチャックを入れると、モーションは子物体しか影響できなくて、親物体の位置、回転などは変化しません。入れないと親の属性も影響されます。

一般的にはBake into poseにチェックを入れたまま、コードで物体を操作するが、ジャンプする場合は入れると親についてるコライダーも移動しない故、ずれが生じる。

つまり正解はApply Root Motionにチェックを入れて、Y軸のBake into poseにチェックを入れない

AnimationTabとrootMotationについて詳しいことは公式ドキュメンテーションで確認：
https://docs.unity3d.com/Manual/RootMotion.html
https://docs.unity3d.com/Manual/class-AnimationClip.html

でも、問題は完全に解決されていない！

##　Bake into poseに入れると、重力に影響されない！？

↑↑↑↑↑アニメーションが完了しても、YUKOちゃんは空中に浮かんだままです。

その原因はBake into poseにチェックを入れると、アニメーションはObjectのTreansformを支配する

影響力の高さ：
Animator > Update Method = Animate Physics

解決策：

Curvesにこういうものを入れましょう。
こうすると、アニメーションも重力に影響されるようになりました！