rig

R の多機能なインストールマネージャーです。簡単に R のインストールやアップデート、複数のバージョンのインストールと切り替えが行えます。機能の詳細や、各 OS ごとのインストールについては、次の rig のサイトで確認してください。

rig のインストール時に、次の P3M のリポジトリの追加と、pak のインストールが同時に行われるので、R を新規インストールするときは、rig を使うことをおすすめします
rig は、既存の R を管理しません。rig を利用したいときは、R をアンインストールしてから、rig でインストールし直すのが良いと思います
rig をインストールした場合は、次の P3M のリポジトリの追加と pak のインストールは必要ありません（二度目になりますが念の為）

P3M（Posit Public Package Manager）

P3M では、CRAN、PyPI、Bioconductor からのパッケージの検索とインストールが行えます。特に、Posit によりビルドされた CRAN のバイナリパッケージを使うことで、インストールを高速化することができます。

リポジトリの追加方法は、ユーザーガイドを御覧ください
Linux で、バイナリービルドパッケージを使用してインストールを高速化したいときは、Set up your environment to install R packages from cranの「Linux Distribution: what linux distribution are you using?」でディストリビューションを選択してください
リポジトリ設定のコード例
- これは、debian12 の場合です
- P3M の URL は上で取得したURLに変更してください
- R のコンソールで実行する
P3M のリポジトリの設定
```
local({
  repos <- c(P3M = "https://packagemanager.posit.co/cran/__linux__/bookworm/latest")
  options(repos = c(repos, getOption("repos")))
})
```
- この設定は、現在開いているセッションのみ有効です
常にリポジトリ設定が有効になるようにするには
- 次のコードを R のコンソールで実行すると.Rprofile に上のコードを追加することができます
- やはり P3M の URL は、自分の環境にあった URL に変更してください
.Rprofile に追加
```
add.Rprofile <- 'local({
  repos <- c(P3M = "https://packagemanager.posit.co/cran/__linux__/bookworm/latest")
  options(repos = c(repos, getOption("repos")))
})
'
cat(add.Rprofile, file = ".Rprofile", append = TRUE)
```
- 自分の環境では正しく動作することを確認していますが、実行は自己責任でお願いします
現在設定されているリポジトリは、getOption("repos") で確認できます
ここまで R での使用を前提に書いてきましたが、P3M は、Python でも使えます。Configuring Python Environments

pak

pak を使えば pak::pkg_install() だけで、install.packages() やdevtools::install_github() の代わりに、CRAN、Bioconductor、GitHub、URL、gitリポジトリ、ローカルファイルやディレクトリから R パッケージをインストールすることができます。他の機能や各 OS の対応状況は、次の pak のサイトで確認してください。

特に、Linux で pak を使う上で嬉しいのは、パッケージインストール時にシステム依存関係を確認して、必要なシステムパッケージを自動的にインストールしてくれるところです
既存の R にバイナリビルドパッケージをインストールするときは、R のコンソールで次のコードを実行してください
- １行のコードでは見にくいので、All about installing pak.に載っている方のコードを記載しておきます
バイナリビルドパッケージのインストール
```
install.packages("pak", repos = sprintf(
  "https://r-lib.github.io/p/pak/stable/%s/%s/%s",
  .Platform$pkgType,
  R.Version()$os,
  R.Version()$arch
))
```
インストール関数は、pak::pkg_install() と書いたが、実は pak::pak() というとても入力が速く簡単な関数でパッケージのインストールが行える
例
```
pak::pak("tidyverse")
```
- これだけで debian12（chromebook）において、事前にシステム依存ファイルをインストールすることなく、tidyverse のインストールができた
- P3M とともに使用して tidyverse のインストールが２分弱でできた
- これに感動してこの記事を書いた