遺伝研スパコンで全部入りのSingularityコンテナイメージファイルをつかう

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どうやらsifファイルがあるっぽい。

スパコンに入ってqlogin（作業環境に移動）したあと以下のコマンドでもってくる。

[xxx@atxxx ~]$ singularity pull shub://oogasawa/singularity-ubuntu18
INFO:    Use image from cache

エイリアスをつける
[xxx@xxx ~]$ alias sing="singularity exec $HOME/singularity-ubuntu18_latest.sif"

Rを起動
[xxx@atxxx ~]$sing R

singularityコンテナから起動できた。