ブランチ状態で
ターミナルで$ git merge masterを実行する
この方法をとるとコンフリクトを起こす可能性があります。
それをどのようにしたら良いかというと
まずコンフリクトしている場所ですが、ターミナルにコンフリクトしている場所が書いてあります。
また、コードエディター（自分だとVscode）を開いてもらうとわかるのですが、コンフリクトしている場所のファイル名が紫色になっています。そこを開いてもらい、最新を適用するか、ブランチのコードを反映させるかを選択出来ますので、これを行ってもらえれば問題ありません。
また、Git Hubのデスクトップ用のアプリケーションを使用する。