実際には色々考えられるとは思いますが、まずはエラーメッセージがあるかないかで対応が異なると思います。
社内のシステム側にエラーメッセージが無い場合
ここではSalesforceに接続できているかを確認するのがいいと思います。
ログインに使っているユーザのログイン履歴を見ることで判断できることがあります。
ログイン履歴が無い
ネットワークの問題かもしれません。Salesforceに到達できていません。
ログイン履歴をみたところログインできていないことが分かり、原因を調べたところアップロード出来ないＰＣがある拠点のグローバルIP第4オクテットが変わっていました。
信頼済みIP範囲に拠点グローバルIPを追加することでアップロードできるようになりました。
ブラウザではアクセスできていたのですがバッチだとはじかれていたようです。
ログイン履歴がある。
ログイン履歴の中にヒントとなるエラーメッセージがあるかもしれません。Salesforceの中でのエラーの場合、通常なら社内のシステム側にエラーメッセージが通知されているとは思います。無い場合は社内システムが受け取れてない（バグ、あるいは機能がない）のでしょう。