はじめに

Claude Code を使い始めると、設定ファイルの多さに戸惑う方が多いのではないでしょうか。

CLAUDE.md と .claude/ フォルダの違いは？
settings.json と commands/ と rules/ はどう使い分ける？
サブディレクトリの CLAUDE.md はいつ読み込まれる？

本記事では、これらの疑問に体系的に答え、読み込みタイミングの違いを明確にします。

本記事は2026年1月時点の情報に基づいています。

全体像

まず、Claude Code の設定ファイル構成を図で確認しましょう。

my-project/
├── CLAUDE.md                    # メイン指示ファイル（自動読み込み）
├── CLAUDE.local.md              # ローカル専用（Git管理外）
├── .claude/
│   ├── CLAUDE.md                # 代替配置も可能
│   ├── settings.json            # ツール許可・MCP設定
│   ├── commands/
│   │   └── deploy.md            # カスタムコマンド定義
│   └── rules/
│       └── frontend.md          # 条件付きルール
├── src/
│   ├── CLAUDE.md                # サブディレクトリ用（オンデマンド）
│   └── components/
│       └── CLAUDE.md            # さらに深い階層も可

役割の違い（要約）

ファイル/フォルダ	役割	読み込みタイミング
`CLAUDE.md`（ルート）	Claude への指示・ガイダンス	セッション開始時
`CLAUDE.md`（サブディレクトリ）	特定ディレクトリ用の指示	オンデマンド（ファイルアクセス時）
`.claude/settings.json`	ツール許可・MCP設定	セッション開始時
`.claude/commands/*.md`	カスタムスラッシュコマンド	コマンド実行時
`.claude/rules/*.md`	条件付きの詳細ルール	条件に応じて

CLAUDE.md の役割

基本的な役割

CLAUDE.md はClaude への指示・ガイダンスを記述するファイルです。

プロジェクトのコンテキスト
コーディング規約
重要なコマンドやルール
禁止事項

配置場所と優先順位

Claude Code は以下の順序で CLAUDE.md を検索・読み込みます：

~/.claude/CLAUDE.md - ユーザーグローバル設定
プロジェクトルートの CLAUDE.md または .claude/CLAUDE.md
CLAUDE.local.md - ローカル専用（Git管理外推奨）

記述例

# プロジェクト概要

このプロジェクトは Python 3.11 を使用した Web API です。

## コーディング規約

- テストは pytest で実行
- 日本語でコミュニケーション
- 機密情報をコードに含めない

## 重要なコマンド

- `pytest` - テスト実行
- `black .` - フォーマット

サブディレクトリの CLAUDE.md - オンデマンド読み込み

これが最も理解が難しいポイントです

読み込みタイミングの違い

配置場所	読み込みタイミング
ルートの `CLAUDE.md`	セッション開始時に自動読み込み
サブディレクトリの `CLAUDE.md`	そのディレクトリ内のファイルにアクセスした時のみ

なぜオンデマンドなのか

サブディレクトリの CLAUDE.md がオンデマンド読み込みになっている理由は、トークン予算の効率的な管理のためです。

例えば、以下のようなプロジェクト構成があるとします：

my-project/
├── CLAUDE.md                    # 常に読み込み
├── apps/
│   ├── web/
│   │   └── CLAUDE.md            # React のルール
│   └── api/
│       └── CLAUDE.md            # FastAPI のルール
└── infrastructure/
    └── CLAUDE.md                # Terraform のルール

apps/web/Button.tsx を編集する場合：

読み込まれる: ルートの CLAUDE.md + apps/web/CLAUDE.md
読み込まれない: apps/api/CLAUDE.md、infrastructure/CLAUDE.md

これにより、無関係なコンテキストでトークンを消費しません。

使い分けのポイント

情報の種類	配置場所
常に適用すべき基本ルール	ルートの `CLAUDE.md`
特定ディレクトリでのみ必要な詳細	サブディレクトリの `CLAUDE.md`

.claude/settings.json の役割

基本的な役割

settings.json はClaude Code の技術的な設定を記述するファイルです。

確認なしで実行を許可するツール・コマンド
MCP サーバーの設定

記述例

{
  "allowedTools": [
    "bash(npm run build)",
    "bash(npm test)",
    "mcp__github__create_pull_request"
  ],
  "mcpServers": {
    "database": {
      "command": "npx",
      "args": ["@modelcontextprotocol/server-postgres", "postgresql://localhost/mydb"]
    }
  }
}

CLAUDE.md との違い

項目	CLAUDE.md	settings.json
内容	指示・ガイダンス（自然言語）	技術的な設定（JSON）
目的	「何をどう作業すべきか」	「どのツールを使えるか」
形式	Markdown	JSON

.claude/commands/ の役割

基本的な役割

commands/ フォルダにはカスタムスラッシュコマンドを定義します。

/deploy と入力すると、対応する .md ファイルの内容がプロンプトとして送信されます。

記述例

.claude/commands/deploy.md:

本番環境へのデプロイを実行してください。

1. まず `npm test` で全テストが通ることを確認
2. `npm run build` でビルド
3. `./scripts/deploy.sh production` を実行
4. デプロイ完了後、ヘルスチェックを確認

引数の受け取り

$ARGUMENTS で引数を受け取れます：

.claude/commands/fix-issue.md:

GitHub Issue #$ARGUMENTS の内容を確認し、修正を実装してください。

使用時：/fix-issue 123 → Issue #123 を修正

.claude/rules/ の役割

基本的な役割

rules/ フォルダには条件付きで適用されるルールを定義します。

rules/ は CLAUDE.md の内容を分割し、コンテキストを抑えるために使用します

CLAUDE.md との違い

項目	CLAUDE.md	rules/*.md
読み込み	セッション開始時に必ず読み込み	条件に応じて読み込み
用途	常に必要な基本ルール	特定の作業時のみ必要なルール

使い分けの例

.claude/
├── CLAUDE.md                    # 常に適用すべきルール
└── rules/
    ├── frontend.md              # React 作業時のみ
    ├── backend.md               # API 作業時のみ
    └── testing.md               # テスト作成時のみ

CLAUDE.md に記載すべきこと（ルール分割した場合）：

## プロジェクトルール

詳細なルールは `.claude/rules/` に分割されています：

- `frontend.md` - React/TypeScript のコーディング規約
- `backend.md` - API 設計・データベース操作のルール
- `testing.md` - テスト作成のガイドライン

## 重要（常に適用）

- コミット前に必ず `npm test` を実行
- 日本語でコミュニケーション
- 機密情報をコードに含めない

読み込みタイミングの比較表

ファイル	読み込みタイミング	用途
ルートの `CLAUDE.md`	セッション開始時	常に必要な指示
サブディレクトリの `CLAUDE.md`	ファイルアクセス時（オンデマンド）	特定ディレクトリ用の指示
`.claude/settings.json`	セッション開始時	ツール許可・MCP設定
`.claude/commands/*.md`	コマンド実行時	カスタムコマンド
`.claude/rules/*.md`	条件に応じて	詳細ルール

使い分けのベストプラクティス

1. 常に適用すべきルールは CLAUDE.md に

# CLAUDE.md

## 基本ルール

- 日本語でコミュニケーション
- コミット前にテスト実行
- 機密情報を含めない

2. 特定ディレクトリのルールはサブディレクトリの CLAUDE.md に

# src/components/CLAUDE.md

## React コンポーネントのルール

- 関数コンポーネントを使用
- Props は型定義必須
- Storybook のストーリーを作成

3. 繰り返すワークフローは commands/ に

# .claude/commands/review.md

コードレビューを実行してください。
1. 変更ファイルの一覧を確認
2. 各ファイルの変更内容をレビュー
3. 問題点と改善提案をまとめる

4. 詳細な条件付きルールは rules/ に

# .claude/rules/security.md

## セキュリティルール

このルールは認証・認可に関するコードを扱う際に適用されます。

- SQLインジェクション対策を確認
- 入力値のバリデーションを確認
- 機密情報のログ出力を禁止

まとめ

ファイル	「何を書くか」	「いつ読まれるか」
`CLAUDE.md`（ルート）	基本的な指示・ルール	セッション開始時
`CLAUDE.md`（サブディレクトリ）	特定ディレクトリ用のルール	オンデマンド
`settings.json`	ツール許可・MCP設定	セッション開始時
`commands/*.md`	カスタムコマンド	コマンド実行時
`rules/*.md`	条件付きの詳細ルール	条件に応じて

ポイント:

CLAUDE.md → 指示・ガイダンス（何をどう作業すべきか）
.claude/ → 設定・機能拡張（どのツールを使えるか）
サブディレクトリの CLAUDE.md → オンデマンド読み込み（トークン節約）

参考リンク

本記事は2026年1月27日時点の情報に基づいています。