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Magics installの対処法

Last updated at Posted at 2020-09-22

解決方法見つからなかった

Magicsとは

MagicsはECMWFの気象プロットのソフトウェアでpythonとか直接アクセスしたりMetviewを使ってアクセスすることもできる。

機能

等圧線、風車、観測、衛星画像、シンボル、テキスト、軸、グラフのプロットをサポートしている。

GRIBのデータや、ガウスグリッド、等間隔グリッド、フィットデータをプロットできる

インストール方法

$ pip install Magics
システムの依存関係があるので、Ubuntu 18.04だったらlibmagplus3v5をインストールしてください。
$ sudo apt-get install libmagplus3v5

ここから、エラーがでる。
コンテナは、ubuntuのこれを使っている
gcr.io/deeplearning-platform-release/tf2-cpu.2-3

以下のコマンドを打つとエラーが表示される

!python -m Magics selfcheck


Traceback (most recent call last):
  File "/opt/conda/lib/python3.7/runpy.py", line 193, in _run_module_as_main
    "__main__", mod_spec)
  File "/opt/conda/lib/python3.7/runpy.py", line 85, in _run_code
    exec(code, run_globals)
  File "/opt/conda/lib/python3.7/site-packages/Magics/__main__.py", line 36, in <module>
    main()
  File "/opt/conda/lib/python3.7/site-packages/Magics/__main__.py", line 25, in main
    from . import macro
  File "/opt/conda/lib/python3.7/site-packages/Magics/macro.py", line 14, in <module>
    from . import Magics
  File "/opt/conda/lib/python3.7/site-packages/Magics/Magics.py", line 206, in <module>
    py_open = dll.py_open
  File "/opt/conda/lib/python3.7/ctypes/__init__.py", line 377, in __getattr__
    func = self.__getitem__(name)
  File "/opt/conda/lib/python3.7/ctypes/__init__.py", line 382, in __getitem__
    func = self._FuncPtr((name_or_ordinal, self))
AttributeError: /usr/lib/x86_64-linux-gnu/libMagPlus.so.3: undefined symbol: py_open

py_openがないとなっているので、pipでインストール

pip install pyopen

エラーがでるので、これもやる
pip install netCDF4

やっとエラーが解消
!nosetests

もう一度トライしてみるがやっぱりエラー
python -m Magics selfcheck

インストールガイドはここ
https://confluence.ecmwf.int/display/MAGP/Installation+Guide

Magicsのバージョンはドキュメントだと4.0.0になっているのに、以下のpackageでは
1.5.0になっている。
https://pypi.org/project/Magics/

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