##File IDとは？
UnityのアセットはGuidで管理されています。SceneやPrefab内(Hierarchy上)ではFile IDで管理されています。

samle.unity

--- !u!4 &1781688880
Transform:
  m_GameObject: {fileID: 1781688879}

##2019.2以降でのFile IDの取得
GlobalObjectIdを使うと楽です。もちろんエディタ上でしか動作しません。

UnityEngine.Object targetObject = Selection.activeObject;
// GlobalObjectIdに変換
var id = GlobalObjectId.GetGlobalObjectIdSlow(targetObject);
// File ID
id.targetObjectId
// PrefabならInstance IDが入る Prefabで無ければ0
id.targetPrefabId

// GUID Prefabなら参照元(親)のGuidがIDが入る
id.assetGUID
// アセットの種別 0 = Null, 1 = Imported Asset, 2 = Scene Object, 3 = Source Asset
id.identifierType

シリアライズ、デシリアライズ

シリアライズ

ToString()がオーバーライドされていてGlobalObjectIdを文字列にしてくれるので便利。Editor拡張に優しいですね。

下記のようなフォーマットで出力されます。
GlobalObjectId_V1-{identifierType}-{assetGUID}-{targetObjectId}-{targetPrefabId}
デフォルト
GlobalObjectId_V1-0-00000000000000000000000000000000-0-0

var id = GlobalObjectId.GetGlobalObjectIdSlow(targetObject);
var idString = id.ToString();
Debug.Log(idString);
// [Console] GlobalObjectId_V1-x-x-x-x

デシリアライズ

上記で言うidStringをTryParseにそのまま突っ込むだけでOK。便利

if (GlobalObjectId.TryParse(idString, out GlobalObjectId result))
{
    switch (result.identifierType)
    {
        // プロジェクト内のアセッは簡単
        case 1:
            var obj = GlobalObjectId.GlobalObjectIdentifierToObjectSlow(result);
            Debug.Log(obj.name);
            break;

        // シーン上のアセットは取得が面倒だし重い
        case 2 :
            // 多分、シーンが開いていないと取得できません。
            // 1. シーン上のすべてのgameObjectをGlobalObjectIdに変換
            var sceneObjects = GameObject.FindObjectsOfType<GameObject>();
            var sceneObjectIds = new GlobalObjectId[sceneObjects.Length];
            GlobalObjectId.GetGlobalObjectIdsSlow(sceneObjects, sceneObjectIds);

            // 2. 一致するものを探す
            for (var i = 0; i < sceneObjectIds.Length; i++)
            {
                if (sceneObjectIds[i].Equals(result))
                {
                    Debug.Log(sceneObjects[i].name);
                    break;
                }
            }
            break;
    }
}

##2019.2未満でのFile IDの取得
取得できるだけありがたいですが、触れてはいけない部分から取得してる気がして若干怖いです。
m_LocalIdentfierInFileがスペルミスしてるので気をつけてください。

var inspectorModeInfo = typeof(SerializedObject).GetProperty("inspectorMode", BindingFlags.NonPublic | BindingFlags.Instance);
var serializedObject = new SerializedObject(Selection.activeObject);
inspectorModeInfo.SetValue(serializedObject, InspectorMode.Debug, null);
var localIdProp = serializedObject.FindProperty("m_LocalIdentfierInFile");

//File ID
Debug.Log(localIdProp.intValue);

参考

How to get the Local Identifier In File for scene objects - Unity Foru