FASTAファイルの制御文字(SOH)問題を解決する
制御文字によるFASTAエントリーの不適切な連結は、BLASTによる配列解析に重大な影響を与える可能性があります。本記事では、FASTAファイル内で発見された制御文字(SOH)の問題に対して、以下の内容を解説します:
- キャレット表記を用いた制御文字の可視化と変換
- Pythonによる実用的な解決スクリプトの実装
- BLASTでの正常な解析を実現するためのエントリー分割手法
特に、2つの専用スクリプト(制御文字変換スクリプトとFASTAエントリー分割スクリプト)の実装について、具体的なコード例とともに詳しく説明しています。
同様の問題でお困りの方の実装の参考になれば幸いです。
以下の記事で詳しく説明しています。