Apache設定ファイル (/etc/httpd/conf/httpd.conf) にはSectionという概念があります。
このSection1とSection2の違いについて明確に説明できるでしょうか？
### Section 1: Global Environment
#
# The directives in this section affect the overall operation of Apache,
# such as the number of concurrent requests it can handle or where it
# can find its configuration files.
#
### Section 2: 'Main' server configuration
#
# The directives in this section set up the values used by the 'main'
# server, which responds to any requests that aren't handled by a
# <VirtualHost> definition. These values also provide defaults for
# any <VirtualHost> containers you may define later in the file.
#
# All of these directives may appear inside <VirtualHost> containers,
# in which case these default settings will be overridden for the
# virtual host being defined.
セクション1は「グローバル」、セクション２は「メイン」と書かれているのですが、どっちも言葉の意味が似てるのでわかりにくいですね。
設定ファイル上もセクション１と２の間に明確な文法的仕切りがない（単にコメントで仕切られているだけ）ことが、わかりにくさを後押ししているようです。
わけて理解する必要あるの？
なぜセクション１と２の違いを理解する必要があるのかというと、「コンテキスト」が関係するからです。
| セクション | コンテキスト |
|---|---|
| セクション１ | サーバ設定ファイル(server config) |
| セクション２ | バーチャルホスト(virtual host) |
違いは<VirtualHost>内で設定を上書きできるかどうか
セクション２に書いてる設定は、「バーチャルホストのデフォルト設定」です。
つまり、個別の 内で上書きが可能です。
なので、セクション１の範疇であるServerRoot,User,PidFileなどは<VirtualHost>内で上書きすることはできないのです。
たしかによく考えてみると、UserやPidFileなどはリクエスト毎の設定ではなくデーモン単位の設定なので、これはうなづけますね。