Xubuntu 18.04でのお話。
GUIのマウスの設定で変更できるかと思いきや、一部(GTK2+？)アプリケーションでのみ反映される。めっちゃ使いづらいの・・・

Synclientを使う

現在の値の確認

synclient | grep ScrollDelta

# 右辺が現在値
VertScrollDelta         = 119
HorizScrollDelta        = 119

垂直・水平方向の設定を変えたければ以下の通り値を反転させる。

synclient VertScrollDelta=-119 && synclient HorizScrollDelta=-119

パームリジェクションなど、他にもオプションがあるので調べてみよう。