概要

OpenResty の lua-resty-auto-ssl を使ってる (多分 certbot-auto でも同じ)
気づいたら以下エラーで証明書の発行がエラーになってた

INFO: Using main config file /path/to/resty-auto-ssl/letsencrypt/config
+ Generating account key...
+ Registering account key with ACME server...\


Error registering account key. See message above for more information.
 err: # !! WARNING !! Extra configuration directory /path/to/resty-auto-ssl/letsencrypt/conf.d exists, but no configuration found in it.
  + ERROR: An error occurred while sending post-request to https://acme-v01.api.letsencrypt.org/acme/new-reg (Status 400)

Details:
{
  "type": "urn:acme:error:malformed",
  "detail": "Provided agreement URL [https://letsencrypt.org/documents/LE-SA-v1.1.1-August-1-2016.pdf] does not match current agreement URL [https://letsencrypt.org/documents/LE-SA-v1.2-November-15-2017.pdf]",
  "status": 400
}

...

原因

Details にある通りデフォルトで指定しているライセンスファイルが今現在指定すべきものと異なるせい

解決策

lua-resty-auto-ssl

https://github.com/GUI/lua-resty-auto-ssl#advanced-lets-encrypt-configuration にあるように設定ファイルを置く
cond.d 配下に置けば何でも良さそう
例

$ cat /path/to/resty-auto-ssl/letsencrypt/conf.d/custom.sh
LICENSE="https://letsencrypt.org/documents/LE-SA-v1.2-November-15-2017.pdf"

certbot-auto

試してないけど以下でできるかも？
- https://github.com/certbot/certbot/blob/master/tests/letstest/testdata/sample-config/accounts/acme-staging.api.letsencrypt.org/directory/48d6b9e8d767eccf7e4d877d6ffa81e3/regr.json のようなファイルが /etc/letsencrypt/accounts/acme-v01.api.letsencrypt.org/directory/**/regr.json とかにある
- agreement や terms_of_service に同様の指定があるのでこれを書き換えればいけるかも