チャージポンプ（負電圧）がきっかけで調べ初めたこと。

1MHzのクロックをESP8266でどう出力するのか。

「ファンクションジェネレーターが壊れて困っている。Arduinoで50%のDuty比で1MHzを出したい」という質問者に対して、Resinatorさんの回答として delayMicroseconds()使用が記載されている。

~~次に時間ができる時に試す予定。~~(下の方で試した。)

同じ人の他の回答としては PWM を使う、とやはりある。でもこの人はPWMを使ったことがないとのこと。

あと以下が気になった。

Digital write takes about 4us so thats not an option for even moderate frequencies direct port addressing is what you need

これが本当ならGPIOの変更自体を変えないといけないということだろう。

PORTB = B100000;         // Digital pin 13 high

のようにしているのは、この問題の回避なのかもしれない。以下を使うよりは上を使う方がいいのだろうか。

gpio.write(4, gpio.HIGH)

ESP8266で PORTBへの代入例はあった。
http://www.esp8266.com/viewtopic.php?p=29911

(追記 2016/02/08)

とりあえず usleep() を delayMicroseconds()に変更してみたが、速くはならなかった。

Arduino IDEでESP8266のコードに PORTBを以下のように使おうとしたが、PORTBは見つかりませんとなった。

PORTB |= B10000;

PORTBを使っているコードは AVR/io.h をincludeしているなどで、こちらで同じものを探したが見つかっていない。

別途、digitalWrite()が遅い（複数の処理をしているため)という情報があったので、digitalWrite()の中身を見た。

上記の中で
extern void ICACHE_RAM_ATTR __digitalWrite(uint8_t pin, uint8_t val) {
にて複数のifやelseなどを使っているのが遅いのだろうか、と疑問に思った。

見ていると GPOS, GPOC というレジスタ？に値を設定しているようだ。

GPOS = (1 << 4);のように使うとIO4のピンがHighレベルとなり、GPOC = (1 << 4);のようにするとLowレベルとなった。

これらをdigitalWrite()と組合せて試したが、速くはならなかった。

移植性を考えると、GPOS, GPOCを使うよりは digitalWrite()を使っておくほうがやはりいい。