最新バージョンの litebox 2.11.1 を利用してライトボックスを実装しました。

IE11 だけポップアップを開くと、画像の位置ではなくページ上部が表示されるバグ？があります。

バージョンを 2.10.0 に落としたところ、IE11 でも正常に動きました。

試してはいませんが、2.11.0 でも正常に動作するかもしれません。

製作者が IE11 には対応しない方針なのか、それともバグなのかわかりません。

バグの可能性があるなら、お強い方は Issue をどうぞです。

追記

Issues を見ると指摘あるので、そのうち修正版がでるかもしれません。

Disable Scrolling scrolls to top when image is clicked. #620

追記

2.10.0 の lightbox.css の html.lb-disable-scrolling には position: fixed; が指定されています。

litebox.css（デフォルト）

html.lb-disable-scrolling {
  overflow: hidden;
  /* Position fixed required for iOS. Just putting overflow: hidden; on the body is not enough. */
  position: fixed;
  height: 100vh;
  width: 100vw;
}

下記のように、staticにするとページ上部が表示される問題が解消されるかもしれません。

litebox.css（static

html.lb-disable-scrolling {
    overflow: hidden;
    position: static;
    height: 100vh;
    width: 100vw;
}