はじめに

MacOS(Catalina)におけるRStanの入れ方をまとめました。

環境

macOS Catalina 10.15.7
R version 3.6.1 (2019-07-05)
RStudio version 1.1.456

事前準備

V8をインストール
ターミナルを起動し、v8をインストール。
他にも足りないものがあるかもしれないが、現在の環境ではこれだけ。
```
brew install v8
```
gfortranのインストール

githubのページからgfortran-10.2-Catalina.dmgをダウンロードし、右クリックでこのアプリケーションで開く-インストーラ(デフォルト)から手順に従ってインストールをする。これを入れないと次のR toolchainをうまくインストールできない。
R toolchainのインストール

githubのページからmacos-rtool-4.0.0.pkgをダウンロードし、gfortranのインストールと同じ手順でインストール。
PCの再起動をする

RStanのインストール

RStudioを開きます。コンソールで以下を実行
C++ toolchainをインストール。
```
install.packages("Rcpp", repos = "https://rcppcore.github.io/drat")
```

improve the estimation speed of the mode

dotR <- file.path(Sys.getenv("HOME"), ".R")
if (!file.exists(dotR)) dir.create(dotR)
M <- file.path(dotR, "Makevars")
if (!file.exists(M)) file.create(M)
cat("\nCXX14FLAGS += -O3 -mtune=native -arch x86_64 -ftemplate-depth-256",
file = M, sep = "\n", append = FALSE)

RStanが既に入っている場合への対策として、以下をコンソールで実行
```
remove.packages("rstan")
```

if (file.exists(".RData")) file.remove(".RData")

RStudioを再起動
次をコンソールで実行
インストール時の設定をする。
```
Sys.setenv(MAKEFLAGS = "-j4") # four cores used
```

RStanをインストール

install.packages("rstan", repos = "https://cloud.r-project.org/", dependencies = TRUE)

RStanの動作確認

RStanをインポート
```
library(rstan)
```
無事に入っていればrstanのVersionが3行目で表示される

参考文献