環境

Python 3.10.2
pandas 1.5.3

やりたいこと

pandas.DataFrame.pivot_tableを使って、以下のような集計を行いたいです。

>>> df = pandas.DataFrame(
        {
            "count": [1, 2, 3, 4],
            "phase": ["A", "A", "B", "B"],
            "user_id": ["alice", "alice", "alice", "bob"],
        })

>>> df
   count phase user_id
0      1     A   alice
1      2     A   alice
2      3     B   alice
3      4     B     bob

>>> df.dtypes
count       int64
phase      object
user_id    object
dtype: object

>>> df.pivot_table(values="count", columns="phase", index="user_id", aggfunc=numpy.sum)
phase      A    B
user_id          
alice    3.0  3.0
bob      NaN  4.0

起きたこと

空のDataFrameに対してpivot_tableメソッドを実行したところ、「If any error is raised, this will raise an exception in a future version of pandas. Drop these columns to avoid this warning.」という警告が発生しました。
警告メッセージの内容はよく分かりませんでした。

>>> df_empty = pandas.DataFrame(columns=["count","phase","user_id"])

>>> df_empty
Empty DataFrame
Columns: [count, phase, user_id]
Index: []

>>> df_empty.dtypes
count      object
phase      object
user_id    object
dtype: object

>>> df_empty.pivot_table(values="count", columns="phase", index="user_id", aggfunc=numpy.sum)
<ipython-input-64-c704905fca9d>:1: FutureWarning: The operation <function sum at 0x7f1ba2d8edd0> failed on a column. If any error is raised, this will raise an exception in a future version of pandas. Drop these columns to avoid this warning.
  df_empty.pivot_table(values="count", columns="phase", index="user_id", aggfunc=numpy.sum)

Empty DataFrame
Columns: []
Index: []

対策

count列の型をobjectからint64に変更したら、警告は出なくなりました。なぜ列の型を変更したら、警告が出なくなったのかは分かりません。。。列の型の指定は間違っていないので、問題はないでしょう。

>>> df_empty2 = df_empty.astype({"count":"int64"})

>>> df_empty2.dtypes
count       int64
phase      object
user_id    object
dtype: object


>>> df_empty2.pivot_table(values="count", columns="phase", index="user_id", aggfunc=numpy.sum)
Empty DataFrame
Columns: []
Index: []