IGV（Integrative Genomics Viewer）未使用者にLinuxでインストール＋起動してもらうためのメモ

IGVとは？

ゲノムブラウザは、遺伝子モデルやRNA-seq、ChIP-seqなどのオミクスデータといった、ゲノム上に定義された様々なデータを可視化するツールです。
IGV（Integrative Genomics Viewer）はアメリカのBroad Instituteの開発したGUIのゲノムブラウザです。

インストール＋起動

準備

java -version で Java 1.8がインストールされているかを確認しましょう。
インストールされていなかったらインストールしてください。

インストール

wget http://data.broadinstitute.org/igv/projects/downloads/2.4/IGV_2.4.19.zip
unzip IGV_2.4.19.zip
cd IGV_2.4.19
chmod 700 igv.sh

起動

./igv.sh

こうなります:

さらなる使い方

• IGV User Guide http://software.broadinstitute.org/software/igv/UserGuide