install.packagesでインストールするpathを変更する

プロジェクトごとにライブラリのインストールするpathを変更したかったのでメモ。

$ tree
.
└── library

> .libPaths()
[1] "/Users/ysk24ok/Library/R/3.4/library"
[2] "/Library/Frameworks/R.framework/Versions/3.4/Resources/library"

1. install.packagesのlib引数を指定する

> install.packages("dplyr", lib="./library")

install.packagesを実行するたびに引数を指定する必要がある。

2. .libPathsに指定する

> .libPaths("./library")
> .libPaths()
[1] "/Users/ysk24ok/testr/library"
[2] "/Library/Frameworks/R.framework/Versions/3.4/Resources/library"
> install.packages("dplyr")

.Rprofile内であらかじめ指定しておけば引数無しでinstall.packagesを実行できるので便利。

注意

.Rprofile内で.libPaths("./library")と指定していても、
R CMD INSTALLで自作ライブラリなどをインストールする場合、
依存ライブラリの参照先として/Users/ysk24ok/testr/libraryは見ないため以下のようなエラーが出る
（インストール先は/Users/ysk24ok/testr/libraryになっている）。

$ R CMD INSTALL IPinYouExp
Error in loadNamespace(name) : there is no package called 'roxygen2'
Calls: :: ... tryCatch -> tryCatchList -> tryCatchOne -> <Anonymous>
Execution halted
ERROR: configuration failed for package ‘IPinYouExp’
* removing ‘/Users/ysk24ok/testr/library/IPinYouExp’

この場合、R_LIBS_USERにパスをセットする。

$ R_LIBS_USER=/Users/ysk24ok/testr/library R CMD INSTALL IPinYouExp

参考