USCF Chimeraをダウンロードする。
https://www.cgl.ucsf.edu/chimera/download.html
Chimeraを開き、File→Openからタンパク質pdbファイルを読み込む。
Favorite→Comannd Lineでコマンドラインを読み込む
下の行にコマンドラインが表示されるのでそこに
set bg_color white
と入力し背景を白くする。
α-helixの部分を赤くする。
color red helix
β-sheetの部分を青くする。
color blue strand
基質部分を強調する。Select→Residue→all nonstandardで基質を選択。
基質原子をボールで表示する。Actions→Atom/Bonds→sphereを選択。
もしそれでも原子が大きくならない場合 (金属イオンなど、、、) Actions→Inspectを選択し、radius:の数字を大きくする。
完成図はこのようになる。
