メリット

機能の再利用ができる。(特にORM)
新しいプロジェクトを作らなくて済む。

適当なクラス(例:batch/HogeMain.java)に main() 関数を作成し、以下のコマンドで実行できます。

開発環境の場合
$ activator "run-main batch.HogeMain"

デプロイ環境の場合
$ java -cp lib/* batch.HogeMain

ただしアプリが起動されていないと実行できない(ORMなど設定や状態に依存する)ものは例外を吐いたりします。その場合、以下のように Play を実行状態にしてあげれば良いようです。

Play 2.3 まで

Scala

Play.start(new play.api.DefaultApplication(new java.io.File("."), getClass.getClassLoader, None, Mode.Prod))

Java

Play.start(new play.api.DefaultApplication(new java.io.File("."), getClass().getClassLoader(), null, Mode.Prod()));

Play 2.4 の場合

Scala

val env = new Environment(new java.io.File("."), getClass.getClassLoader, Mode.Prod)
val context = ApplicationLoader.createContext(env)
val loader = ApplicationLoader(context)
val app = loader.load(context)
Play.start(app);

参考にさせて頂きました！
http://argius.hatenablog.jp/entry/20121011/1349953945