自分と学生さんのプロジェクト管理に、GitHubとZenHubを使っています。ZenHubはGitHub用のChrome拡張機能で、GitHubにタスクボード、estimateというストーリーポイント機能、バーンダウンチャートなどを追加できます。
詳しくは、こちらの記事が、わかりやすくて良いですね http://dev.classmethod.jp/etc/github-discussion-sidebar/
これを使って、もう少しきっちりアジャイルなことをしてみたかったので、最近発売された「C#実践開発手法」で勉強してみました。ほかの資料も調べながら理解した範囲では、
スクラムのスプリント -> Milestone
ユーザーストーリー -> issue (参考資料：https://confluence.atlassian.com/display/AGILE/Story）
タスク -> issue の記載の中にマークダウンでチェックリストを作る
という感じで行えば、とりあえずアジャイルな管理ができるのかな、と思いました。
GitHubのマイルストーンは終了日のみ決めますが、ZenHubのバーンダウンチャートを使う際は、開始日も決める必要があります。スプリントは通常2週間程度らしいので、ZenHubで期間を設定するときも、そのくらいが良いのでしょう。
各issueにはEstimateを設定できます。それが、Burndownに反映されるので、スプリントの進捗を見るのに大変便利です。
アジャイルとかスクラムに詳しい方のご意見いただければ、幸いです。まだ私自身不慣れですし、学生さんにも十分浸透してませんが、今後も勉強して、効果的なプロジェクト管理を行いたいです。