Mac + Rの環境でplotする時には.Rprofileでフォントの指定をするのが定番になっている(例: Mac OSXのRで日本語をプロットしたい - 驚異のアニヲタ社会復帰への道).
しかし,これだけでは
png("/tmp/test.png")
plot(iris, main = "アヤメのデータ")
dev.off()
とした場合にmain部分が文字化けする.
これを回避するには
png("/tmp/test.png")
par(family="HiraMaruProN-W4")
plot(iris, main = "アヤメのデータ")
dev.off()
とかやってフォントを指定すれば適切に描画される.