タイトルで説明が終わってしまった。Atom-Lint に限らず lint / hint plugin に install 失敗するものが多くて、エラーメッセージをチラ見すると NT Platform とかなんとか見えて「node module が Windows をサポートしてないのかなー」とか思ったのですが、きちんとメッセージを読むと単に git コマンドがないせいだった。
しかしここでまた Windows に git を install する際には Mac / Linux で見慣れない選択肢がモリモリ出てくるのですよ。
私は Windows PowerShell から git を使うこともあるかもなと、 "Use Git from the Windows Command Prompt", "Checkout Windows-style, commit Unix-style line endings" を選んでおきました。