お世話になります。
AWSキッチンのシェフです。
定期的にとるようにしている方が多いのではないかとは思うのですが、
バックアップ取得中に操作しても安全か気になったことはないでしょうか？
サポートの方に確認したところ、RDSのバックアップは瞬間的に I/O を停止し、整合性のあるスナップショットを取得したのち、I/O を再開し、その後当該スナップショットは自動でS3 へ保存される動作のようです。
I/O が停止されている最中に操作をされていも、その操作はロストするわけではなく再開後に適切に処理されますので、表面上は遅延として実行されるそうです。
AWSのサービスはよく考えられていると感心してしまいますね。